如何读取rda格式数据
2019-12-15 本文已影响0人
Jabes
在Differential Dynamics of the Maternal Immune System in Healthy Pregnancy and Preeclampsia 这篇论文中作者提供了一些数据。
原始数据放在了 http://flowrepository.org/id/FR-FCM-ZYRQ.不过这个数据格式是流式数据,格式是fcs的,我安装了FlowJo但是解析出错。
还好,作者也提供了抽取后的特征在这里 https://nalab.stanford.edu/wp-content/uploads/pbmcpedata.zip。但是这个数据提供的格式是Data.rda的,没办法让我导入python去分析。所以这里讲下怎么把R格式的数据导出到csv, 以方便后续数据处理。
1. 安装R语言包
Windows安装很简单,直接在https://cran.r-project.org/bin/windows/base/下载最新版的安装包安装即可,
如果做后续开发还可以考虑安装RStudio https://rstudio.com/products/rstudio/download/#download。
2. 打开安装的R
搜索R就能找到R X86 3.6.2
3. 加载数据
加载很简单,
test <- load('D:\\project\\Immune-System-Research\\feature_data\\Data\\Data.rda')
image.png
查看数据
image.png
查看表
image.png
3.保存数据到csv
> write.csv(pe,"D://pe.csv")
> write.csv(GA,"D://GA.csv")
> write.csv(data,"D://data.csv")
image.png