序列比对？你可能需要一个图形化界面
2020-08-19 本文已影响0人
生信雀
多重序列比对（Multiple-Sequence-Alignment , MSA）应该是序列分析中最为基础的操作了，笔者之前发了很大笔墨介绍了MAFFT这款软件的使用（MAFFT 7.0使用说明），MAFFT的网页版是图形界面，不过运算能力有限。
本地版则取决于自己的电脑配置，或者可以使用服务器进行运算。不管是本地版，还是服务器版，MAFFT都是字符界面。这对于大部分主要从事湿实验的非生信人员很不Nice。
好在BioAider也把MAFFT打包成了图形化界面（Windows和Linunx版本的都有），以后使用MAFFT进行序列比对，只需要拖拖文件，点点鼠标即可。
此外，一起打包的还有另外两款经典的序列序列软件，Muscle和Clustal Omega，同样，Windows和Linunx版本的都有。
尤其是，都额外提供了基于多套不同密码子进行翻译比对功能。
还是直接上图。
1. MAFFT
Windows版本
Linux (Ubuntu16.04）版本BioAider主要是把一些常用参数命名做成了图形化界面，方便不熟悉MAFFT的人能快手上手进行序列比对分析。同时也预留了手动添加其他参数功能（“Others parameter”）,方便熟悉MAFFT的参数党们（老手）折腾。
总结就是，老少皆宜！
打包的另外两款序列比对软件也是同样的模式。
2. Muscle
只展示Windows版本：
3. Clusta Omega
只展示Windows版本：
总结就是，真香真Nice！
附BioAider软件下载地址：https://github.com/ZhijianZhou01/BioAider/releases
