生信学习笔记 —by xiaode

数据下载与整理

linux系统简介

• 基本命名规则 image.png
• 文件夹与文件管理命令 image.png
• 常见参数 image.png
• linux操作流程

1. 准备工作：登入服务器
2. 文本查看、操作、统计命令
   文件查看

常见参数

bioPackages <-c( 
  "stringi",  # 处理字符串
  "GEOquery", # 下载GEO数据
  "limma",    # 差异分析
  "ggfortify", "ggplot2", "pheatmap", "ggstatsplot", "VennDiagram", # 作图
  "clusterProfiler", "org.Hs.eg.db"                                 # 注释
)