思维导图

DAY5-数据结构

要点

（1）R的赋值符号不是等号，而是<-
（2）在Console 控制台输入命令，相当于Linux的命令行
（3）R的代码都是带括号的，括号必须是英文的。
（4）显示工作路径 getwd()
（5）向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。
（6）表格在R语言中改名叫数据框^_
（7）别只复制代码，要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时，除了百度/谷歌搜索以外，用这个命令查看帮助：?read.table，调出对应的帮助文档，翻到example部分研究一下。
（8）数据类型

数据类型

向量和标量的区分

• 元素：数字或者字符串（chr）

标量：一个元素组成的变量
向量：多个元素组成的变量

• 向量是多个元素有序排列的变量，如依次排列的三个数字c(1,2,3)、依次排列的三个字符串c("dd","hh","yy").
• 标量是只有一个元素的变量，可以是一个数字，也可以是一个字符串（字符串要加双引号）。
• 赋值是赋予一个变量一个数值，这里的数值包含数字、字符串或者是数据框等。
• seq
  > x = rep(v, n)

从1开始生成一个递增或递减数值型向量x，最后一个元素绝对值为小于等于|a|的最大整数。

• rep
  rep(v, each = n)

依次对向量v的每个元素复制n此生成新的向量x

从向量中提取元素

• 根据元素位置
• 根据值

数据框

先将示例数据"huahua.txt" "doudou.txt"放至工作目录下。

1.读取本地数据，代码如下

read.table(file="huahua.txt",sep="\t",header=T)
a<-read.table(file="huahua.txt",sep="\t",header=T)

2.设置行名和列名

X<-read.csv('doudou.txt')#X表示一个数据框
colnames()#查看列名
rownames()#查看行名
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

3.数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）
4.变量的保存与重新加载

#这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

5.提取变量
6.直接使用数据框中的变量

• 提取列作散点图

options(stringsAsFactors = T)
a <-data.frame(case=paste0("S",1:9),values=runif(9))
plot(a$case,a$values)

-简易方法：attach

作图时只需输入列名
做完后detach(a)删除

attach(a)
plot(case,values)

-简易方法：with

with(a,{
 plot(case,values)
x<<-summary(values)   #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量，也就是出了大括号仍有效。
})
x #运行完后打印x

课后问题

问：save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found，是为什么，应该怎么解决？

答：可能是变量X赋值时用了小写的x，因此没有找到该文件。解决方法重新赋值X覆盖。