qiime2官方教程亮点回顾

2023-05-20  本文已影响0人  zd200572

做了一次搬运工,把Qiime2官方教程搬到了B站,B站确实有机器的字幕,但是现阶段的AI字幕对于生物领域还是比较不友好的,特别是对于些专有名词,比如qiime直接翻译成china。所以,未来每个人有个专属的工作AI助手应该是个未来的趋势啦!鉴于字幕不好, 我就每个视频把字幕校正了一遍,断断续续有半年多,终于理完啦!字幕重新上传了B站。当然,这也是一个学习的过程,大佬的讲解,让我也学到了不少,这里就选三个亮点分享一下!

首先是视频的网址先放这啦!1 Introduction to the QIIME 2 Cancer Microbiome Intervention video tutorial

带时间轴的PCoA图

25 Beta diversity visualizations给了我一个新的beta多样性分析的维度,时间,当然,这需要longitudinal研究才可以,有没有被惊艳到。


机器学习

一直以为qiime2只是个基本的初级分析工具,应该没有相关插件进行机器学习分析,最后一课发现机器学习能力做得也插棒的,可以直接用,降低了使用门槛,就不需要自己建模或者找第三方的包啦,给力!
在28 Sample classification这一课,比较详细讲解了机器学习的简介,训练和效果评价,以及可能的坑。






漂亮的进化树

这个之前说过啦,这里就不再重复啦,移步这篇文章即可!
漂亮的进化树

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