20191019文献汇报|Host genetics influ

2021-05-13 本文已影响0人 Zukunft_Lab

联合国2017年人口报告称，到2050年，世界人口将达到97.2亿人，2100年将达到111.84亿人，这将对全球粮食供应提出必须增加的需求，而人类对肉类生产日益增长的需求将需要额外的农作物用于动物饲料。畜牧业生产盈利能力也依赖于使用最少的投入来实现最大产出。拿养羊业来说，张小雪老师在他的文章中说过饲料占饲养成本的65-70%；因此，持续努力提高饲料效率(FE)对环境和经济至关重要。所以在畜牧业，可持续畜牧生产必须依赖于提高饲料养分利用率的FE，从而提高盈利能力和减少农业温室气体排放。而瘤胃微生物发酵对宿主的营养起着至关重要的作用，瘤胃微生物区系可能影响FE。但瘤胃微生物区系与FE之间的关系尚不清楚。今天我要汇报的文献算是一篇经典的文献，他的研究很基础，我觉得得到的结果能帮助后研究者们站在这些数据的基础上研究微生物并控制微生物对畜牧业的影响。

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本研究探究瘤胃微生物菌群的宏观组成，评估瘤胃微生物分类特征的遗传性，确定品种、性别和饮食对动物瘤胃微生物菌群的影响。
应用遗传力评估(软件)和GWAS技术，研究肉牛瘤胃微生物的定植与宿主加性遗传效应和基因型的关系。
此外，研究可遗传的瘤胃微生物特征与宿主饲料转化率和瘤胃VFAs相关分析，以及与瘤胃微生物群和饲料转化率相关的单核苷酸多态性。

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技术路线图中规中矩，只要有钱大家都可以模仿重复研究。

1 动物实验和瘤胃取样
2 DNA提取、高通量测序和定量PCR分析
利用宏基因组分析三种牛瘤胃细菌、古生菌的组成与丰度，分析瘤胃微生物特征，并构建瘤胃微生物共表达网络。
3 基因型分析
从每只动物的耳组织中提取基因组DNA，对所有试验牛进行基因型鉴定。单核苷酸多态性用于构建动物模型的基因组关系矩阵G，评估遗传性。已知染色体位置的单核苷酸多态性被用于GWAS。
4 遗传力估计获得个体间的加性遗传关系，估计每个瘤胃微生物特征的遗传力。
5 全基因组关联研究品种、性别、饮食和年龄等因素与基因型的关联分析，可遗传的微生物特征与饲料转化率特征、VFA之间的相关关系分析。