查看BAM/SAM格式文件

samtools view [‐bhuHS] [‐t in.refList] [‐o output] [‐f reqFlag] [‐F skipFlag] [‐q minMapQ] [‐l library] [‐r read‐Group] <in.bam>|<in.sam>

    -b 以BAM格式输出，可以用于samtools的后续分析

    -u 以未压缩的BAM格式输出，可以节约时间，一般在管道执行时使用

    -h 在结果中包含头header

    -H 只输出开头

samtools view -h 文件名 | less -S