Linux环境下安装软件

Linux系统下的软件安装.png

下载软件

1. 下载地址（应用商店）
   conda 镜像站点——eg. 清华 mirror
   在镜像站点进行相应的软件搜索，并复制下载链接地址以备在后面的Xshell操作中软件下载用。
2. 如何下载
   在xshell中运行命令——wget + 软件下载链接地址（注意粘贴时点击鼠标右键，不是
   control+v）
   eg. wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.shLinux-x86_64.sh

安装

1. 安装
   在xshell中运行命令——bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
2. 激活——千万不能忘
   在xshell中运行命令——source ~/.bashrc
   注意：在安装的过程中出现问题，可删除文件后重新安装
3. 添加镜像
   运行命令 conda config --add channels +链接地址

运行软件

1. 查看当前服务器上已安装的所有软件
   在xshell中运行命令——conda list
2. 搜索软件
   conda search fastqc
   注：以数据质控软件fastqc为例
3. 安装软件
   在xshell中运行命令——conda install fastqc -y
   也可以删除已装的软件——conda remove fastqc -y