Linux安装rifdock中遇到的问题

rifdock的下载和安装说明可参考https://github.com/rifdock/rifdock

分别基于服务器gcc是12.1，9.4的版本，安装了Rosetta 3.9的版本，然后再编译安装rifdock，是可以成功的，在rifgen运行时出现报错信息如下：

FAILED ASSERTION:
resname(ala_rot_) == "ALA" EXIT

FROM:
~/software/rifdock-master/schemelib/scheme/chemical/RotamerIndex.hh line: 860

查阅到类似的错误：https://github.com/rifdock/rifdock/issues/119，曹大神推荐使用gcc 6.x版本，为此利用个人账号，非root账户在linux上安装gcc 6.3版本，期间也是遇到各种报错信息，最后参考以下两篇介绍解决：

https://blog.csdn.net/nie19940803/article/details/102408025

https://zhuanlan.zhihu.com/p/357264769

最后gcc安装成功，并将环境设置好，进行Rosetta 3.9安装（需要准备python2.7）

./scons.py -j 16 mode=release bin

Rosetta 3.9成功安装，随后进行rifdock的安装，参考git上的介绍

cd rifdock
mkdir build
cd build
CXX=/my/g++/version CC=/my/gcc/version CMAKE_ROSETTA_PATH=/Path/to/a/rosetta/main cmake .. -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release make -j3 rif_dock_test rifgen

在CXX编译那步，还遇到过小插曲的报错

cmake: ~/Bin/gcc-6.3.0/lib64/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.26' not found (required by cmake)
cmake: ~/Bin/gcc-6.3.0/lib64/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.26' not found (required by /lib/x86_64-linux-gnu/libjsoncpp.so.1)

找了个存在GLIBCXX_3.4.26的库文件链接到lib64目录下，最后成功安装成功

安装日志文件

最后利用rifgen测试

~/Bin/rifdock-master/build/apps/rosetta/rifgen @input/rifgen.flag > rifgen.log 2>&1

成功生成对应的结果文件

结果文件

整体来讲，rifdock在安装时，较为依赖系统环境，中间遇到很多问题，都是边查边解决，不放弃不舍弃多坚持一下，最后实现了此软件的安装和应用