单细胞拟时序分析3-slingshot

2023-10-18  本文已影响0人  oceanandshore

看的成纤维细胞那两篇文章都是用slingshot做的,这个比较简单。

文章1:皮肤炎症激活肠道基质成纤维细胞并促进结肠炎 - PMC (nih.gov)

文章2:毛囊周围真皮前脂肪细胞的抗菌产物对痤疮的病理生理学至关重要 - PMC (nih.gov)

单细胞轨迹分析之应用篇 - 简书 (jianshu.com)

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NBIS系列单细胞转录组数据分析实战(八):拟时序细胞轨迹推断 - 简书 (jianshu.com)
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slingshot下游基因和通路分析包 tradeseq

tradeSeq | Slingshot下游 沿轨迹分析基因表达 - 简书 (jianshu.com)
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文献学习038--[sn+CRISPR-knockout screen]人类DCM和HCM的单核细胞profiling - 简书 (jianshu.com)

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