【单细胞转录组】人类B细胞亚群分析Marker基因汇总

2020-04-05 本文已影响0人 Geekero

由于基因表达跟细胞表面蛋白的表达具有时间差，所以要根据经验具体情况具体分析，内容仅供参考

哺乳类动物B细胞的分化过程主要可分为前B细胞、不成熟B细胞、成熟B细胞、活化B细胞和浆细胞五个阶段。

其中前B细胞和不成熟B细胞的分化是抗原非依赖的，其分化过程在骨髓中进行。抗原依赖阶段是指成熟B细胞在抗原刺激后活化，并继续分化为合成和分泌抗体的浆细胞，这个阶段的分化主要是在外周免疫器官中进行的。

Progenitor B Cell

CD34
CD117/c-kit
Flt-3/Flk-2
IL-7R alpha/CD127
Neprilysin/CD10
Pax5/BSAP
Sca-1/Ly6

Mouse B1 or B2 Progenitor Cell

B220/CD45R
C1qR1/CD93
CD19

Pre-Pro B Cell

B220/CD45R
C1qR1/CD93
CD19
CD24
CD34
CD38
CD43
CD117/c-kit
CXCR4
Flt-3/Flk-2
IL-7R alpha/CD127
Neprilysin/CD10
Pax5/BSAP

Pro-B Cell

B220/CD45R
C1qR1/CD93
CD19
CD24
CD34
CD38
CD43
CD117/c-kit
CD20
IL-3R alpha
IL-7R alpha/CD127
Neprilysin/CD10
Pax5/BSAP

Pre-B Cell

B220/CD45R
C1qR1/CD93
CD19
CD24
CD34
CD38
CD43
CD117/c-kit
CD20
IL-3R alpha
IL-4R alpha
IL-7R alpha/CD127
Neprilysin/CD10
Pax5/BSAP

Immature B Cell

B220/CD45R
C1qR1/CD93
CD19
CD21
CD23/Fc epsilon RII
CD24
CD27/TNFRSF7
CD38
CD40/TNFRSF5
CD43
CD117/c-kit
CD20
IL-4R alpha
IL-7R alpha/CD127
Neprilysin/CD10

Human Transitional B Cell

C1qR1/CD93
CD5
CD19
CD21
CD23/Fc epsilon RII
CD24
CD27/TNFRSF7
CD38
Neprilysin/CD10
TACI/TNFRSF13B
BR3

Mouse Transitional 1 (T1) or Transitional 2 (T2) B Cell (from B2 Progenitor Cell)

B220/CD45R
C1qR1/CD93
CD19
CD24
CD43

Mouse B1a or B1b Cell (from B1 Progenitor Cell)

CD1d
CD5
CD19
CD23/Fc epsilon RII
CD43

Marginal Zone B Cell 边缘区（MZ）B细胞

B220/CD45R
C1qR1/CD93
CD1c/BDCA-1
CD1d
CD19
CD21
CD23/Fc epsilon RII
CD27/TNFRSF7
CD43
CD20
FCRL3/FcRH3
TACI/TNFRSF13B

Follicular B Cell 滤泡（FO）B细胞

B220/CD45R
CD1d
CD19
CD21
CD23/Fc epsilon RII
CD24
CD27/TNFRSF7
CD38
CD43
CD20
CXCR5
MHC class II (I-A/I-E)
Neprilysin/CD10
Siglec-2/CD22
TACI/TNFRSF13B

Activated Germinal Center B Cell

B220/CD45R
CD19
CD27/TNFRSF7
CD38
CD40/TNFRSF5
CD83
CD20
MHC class II (I-A/I-E)
TACI/TNFRSF13B
BR3

Memory B Cell

B220/CD45R
C1qR1/CD93
CD19
CD21
CD27/TNFRSF7
CD40/TNFRSF5
CD20
MHC class II (I-A/I-E)
TACI/TNFRSF13B
CD80
CD84
CD86

Plasmablast

B220/CD45R
BCMA/TNFRSF17
C1qR1/CD93
CD19
CD27/TNFRSF7
CD38
Syndecan-1/CD138

Plasma Cell

B220/CD45R
BCMA/TNFRSF17
BLIMP1/PRDM1
CD19
CD27/TNFRSF7
CD38
CD20
CXCR4
MHC class II (I-A/I-E)
Syndecan-1/CD138
CD139
CD78

Regulatory B Cell 调节性B（Breg）细胞

B220/CD45R
B7-1/CD80
B7-2/CD86
BLIMP1/PRDM1
CD1d
CD5
CD11b/Integrin alpha M
CD19
CD21
CD23/Fc epsilon RII
CD24
CD27/TNFRSF7
CD38
CD40/TNFRSF5
CD44
CD69
CD72
CD20
CD25/IL-2R alpha
CXCR4
DEP-1/CD148
EBI3
EMMPRIN/CD147
HLA-DR
IgM
IL-10
IL-12 R beta 2
IL-12/IL-35 p35
IL-21
IL-21R
IL-23/IL-39 p19
IL-27 R alpha/WSX-1/TCCR
IL-39 (IL-23p19/EBI3)
IRF4
Siglec-2/CD22
STAT1
STAT3
Syndecan-1/CD138
TACI/TNFRSF13B
TGF-beta
TIM-1/KIM-1/HAVCR
TLR4

未成熟B细胞的Marker

未成熟的B细胞表达CD19，CD 20，CD34，CD38和CD45R，但不表达IgM。

成熟B细胞的Marker

对于大多数成熟的B细胞，关键Markers包括IgM和CD19（一种抗原蛋白受体）
- 活化的B细胞：CD30+（一种凋亡调节剂）
- 血浆B细胞：CD19-CD78+

一个Marker基因查找数据库

http://biocc.hrbmu.edu.cn/CellMarker/