一、理解“变量”

给一个字符串进行赋值，比如：rweldwdd='bio'，意思就是这一串字符就是bio。rweldwdd就是一个变量名啦。

echo $rweldwdd就会显示出bio来。
那么把上面这些写入脚本并运行： （注意vim操作，按i键，进行编辑，按esc退出编辑，敲入:wq，保存并退出。

vim tem.sh
rweldwdd='bio'
echo $rweldwdd
bash tem.sh

则会运行sh里面的命令，显示bio字样。这真是一个最简单的脚本啊。

二、参数

在运行程序bash tam.sh p1的时候会出现什么？那就看看tem.sh里面有什么参数了。比如1都可以看作参数。

vim tem.sh
echo $1
bash tem.sh p1 p2

则会打印出第一个数据p1

如果想打印出第10个以后的数据就要用下面的格式

vim tem.sh
echo ${12}  #打括号意思是第几个，$符号是一个参数标志。
bash tem.sh p1 p2 p3 p4 p5 p6 p7 p8 p9 p10 p11 p12

则会打印出p12

三、通配符

常见的*
比如echo s20220323*
则会把当前目录下前缀s20220323的所有文件都显示出来。echo s20220323[1,2]*
则会打印s202203231和s202203232为前缀的所有文件。

四、标准的头文件。

在sh文件里最前面的几行。包括作者，练习方式，版本，参数等。
比如# /bin/bash

五、sh里面的内容

1. 判断语句。

因为使用这个软件的人也许胡乱输入，或者错误输入，所以要针对的给出提示语，让操作者知道有错误了。

2. 什么是循环

理解while 和for（理解得不好，还需要后续学习）

for in i {20..27}; do echo SRR10395*${i}.fastq.gz; done
就是把SRR1039520-SRR1039527这几个fq文件名显示出来。

3.ln命令

是linux系统中一个非常重要命令，英文全称是“link”，即链接的意思，它的功能是为某一个文件在另外一个位置建立一个同步的链接。 一种是hard link，又称为硬链接；另一种是symbolic link，又称为符号链接。

通俗一点理解，可以把硬链接当成源文件的副本，他和源文件一样的大小，但是事实上却不占任何空间。符号链接可以理解为类似windows一样的快捷方式。

六、shell十三问

众神们已经给了很多解释，我只记录自己理解的。https://segmentfault.com/a/1190000004324819
https://blog.csdn.net/xhtchina/article/details/123097589

1.为何叫做shell？

电脑通过“操作系统（OS，Opertating System）这个软件来驱动 ，linux是一个操作系统，我们称之为“核心（kernel）。但是我们不能直接操作kernel（大概是因为我们不能直接输入二进制的命令吧），只能通过一个“外壳”程序，就是 Shell 来与 Kernel 沟通。shell是一个使用者与系统的互动界面（interface），使用者用命令行（command line）来使用系统干活。因此，shell的最简单的定义就是---命令解释器（Command Interpreter）。
不同的 OS 使用不同的 Kernel；同一个 kernel 之上，也可以使用不同的 Shell，常见的 Shell 有sh、bash、csh、ksh 等。大部份的Linux系统的预设shell都是bash。

2.shell prompt（PS1）与 Carriage Return（CR）的关系？

成功登录一个 Shell 终端后，光标左边部分称之为提示符 Prompt，通常一般用户使用$。shell prompt的意思很简单：是shell告诉使用者：您现在可以输入命令行了。
cursor也称为游标，是指示键盘在命令行所输入的位置，使用者每输入一个键，cursor就往后移动一格，直到碰到命令行读进CR（Carriage Return，由Enter键产生）字符为止。CR的意思也很简单：是使用者告诉shell：老兄你可以执行我的命令了。

3.别人echo，你也echo，试问 echo 知多少?

标准的命令行（command line）包含三个部件：command_name option argument
echo命令是将argument送出至标准输出（STDOUT），通常就是在显示器（monitor）上输出。echo在预设上，在显示完argument之后，还会送出一个换行符号（new-line charactor）
如果 echo -n argument，则不会换行了。
再例如：用-e来表示反斜杠为控制字符转换的符号。\t 是表格跳位字符，相当于tab键；\n 是换行字符。
$ echo -e "a\tb\tc\nd\te\tf"
a b c
d e f
注意还有很多类似的反斜杠加字母，作为控制字符的。如\b 是退位字符，也就是BACKSPACE。

4. “”（双引号）与''（单引号）差在哪？

在命令行中用IFS（Internal Field Seperator）分割不同字段。在命令中，如有特殊字符（meta）是要先处理的。除了IFS和CR，下面meta这些很常用。

= : 设定变量。
$ : 作变量或运算替换（请不要与shell prompt搞混了）。
< : 重导向stdin。 > : 重导向stdout。
| : 命令管线。
& : 重导向file descriptor，或将命令置于背境执行。
() : 将其内的命令置于nested subshell执行，或用于运算或命令替换。
{} : 将其内的命令置于non-named function中执行，或用在变量替换的界定范围。

; : 在前一个命令结束时，而忽略其返回值，继续执行下一个命令。
&& : 在前一个命令结束时，若返回值为true，继续执行下一个命令。
|| : 在前一个命令结束时，若返回值为false，继续执行下一个命令。
！: 执行history列表中的命令

在命令行中有时候需要把这些meta关闭，因为不关闭就会先执行这些mata。那就要用到单引号和双引号和escape。
hard quote:' '（单引号），凡在hard quote中的所有meta均被关闭；
soft quote:“”（双引号），在soft quote中大部份meta都会被关闭，但某些则保留（如$）；
escape : \（反斜线），只有紧接在escape（跳脱字符）之后的单一meta才被关闭。

meraners-MacBook:~ meraner$ A='B
> C'
meraners-MacBook:~ meraner$ echo $A #什么都不加输出变量A的值。
B C
meraners-MacBook:~ meraner$ echo "$A" #双引号保留$的meta功能。
B
C
meraners-MacBook:~ meraner$ echo '$A' #单引号关闭了$的meta功能。
$A

meraners-MacBook:~ meraner$ A=B\ C#用反斜杠取消space的meta功能，成为单纯的空格
meraners-MacBook:~ meraner$ echo "$A"
B C

$ A=B\ C
$ echo ' "$A" ' #最外面的是单引号，先执行最外面的命令，则把里面的所有都作为文字输出。
"$A"
$ echo " '$A' " #最外面的是双引号，先执行最外面的命令，把里面的$的变量替换功能保留下来。
'B C'

还记得day9学的awk命令么？用来把文本中的列拎出来的命令哦。用到了单引号。

awk '{print $1":"$2","$3}' test.bed'
具体解释如下：
{ }是将其内一系列command line置于不具名的函式中执行（可简单视为command block），但awk命令却要用大括号来 区分出awk的命令区段（BEGIN，MAIN，END）。上面的hard quote（单引号）就是将原本的{、<space>、$}这几个shell meta关闭，避免掉在shell中遭到处理，而完整的成为awk参数中的command meta。

$ awk '{print $0}' 1.txt
awk "{print \$0}" 1.txt
awk \{print\ \$0\} 1.txt

这三个命令效果一样。单引号和双引号，大不同哦。

5. var=value? export 前后差在哪？

5.1对变量的深入理解

今天的第一部分就提到，变量（variable）就是用一个特定的“名称”（name）来存取一段可以变化的“值”（value）。
变量替换
在命令行中使用者可以使用PATH:/~data/zds209/bin`。
使用区隔符号（：）来达到扩充目的。如果不用这个区隔符号，会怎样呢？

A=BCD
A=$AE #意思是A被重新赋值为AE这个变量的值。
echo $A
    #结果是什么也没有，因为没有 AE这个变量。。

A=BCD
A=${A}E   #用{}将变量名称的范围给明确定义出来echo $A
BCDE

5.2 export是个啥？

在当前shell中所定义的变量，均属于“本地变量”（local variable），只有经过export命令的“输出”处理，才能成为环境变量（environment variable）

$ A=B
$ export A # 这时候A才能作为一个环境变量供其后的命令使用。
$ A=B
$ B=C
$ export $A #这时候B作为环境变量了，因为先执行了$A这个变量的替换操作。相当于export B。

5.3 变量取消

unset A 就是把A变量从环境变量中取消。

$ A=B
$ B=C
$ unset $A #因为先执行$A这个替换，所以实际上取消的是变量B。

变量替换有点儿烧脑。下面对A为null 和unset A的区别加以解释。

$ A=   #变量A值为空null，但是存在这个变量A哦。只不过是null value
$ B=${A=BCD} #既然上面把变量A设定为空，就是不可能有数值，也就不能被赋值了。把BCD赋值给A的这件事儿没发完成啊，A是空滴。。
$ echo $A
                   #A为null（空值），有A这个变量，但是是空的。
$ echo $B
                    #既然A是空，不能被赋值，B展示出A的结果也是空啦。


$ unset A   #变量A取消了，不存在了。。
$ B=${A=BCD} #没有A这个变量的情况下，bash把BCD赋值给了A，然后又把$A赋值给了B。
$ echo $A
BCD
$ echo $B
BCD

简单说，就是如果之前A变量赋值过了，哪怕赋值的是null或者0，或者别的什么，后面B={A=...} 这个命令就是制造了一个变量B，同时制造了变量A，并赋值给A和B。如下：

$ A=xyz
$ B=${A=BCD}
$ echo $A
xyz
$ echo $B
xyz

6. exec 跟 source 差在哪？

6.1 行程（process）

我们所执行的任何程序，都是由父行程（parent process）所产生出来的一个子行程（child process）即sub-shell，子行程在结束后，将返回到父行程去。此一现像在Linux系统中被称为fork。
环境变量只能从父行程到子行程单向继承。换句话说：在子行程中的环境如何变更，均不会影响父行程的环境。

6.2脚本（script）

将你平时在shell prompt后所输入的多行command line依序写入一个文件去。其中再加上一些条件判断、互动界面、参数运用、函数调用等等技巧，得以让script更加“聪明”的执行，但若撇开这些技巧不谈，我们真的可以简单的看成script只不过依次执行预先写好的命令行而已。

6.3 source命令

我们跑一个脚本的时候会产生相应子进程（ child process）。 当child结束后，会返回parent，但parent的环境是不会因child的改变而改变的。 环境元数很多，凡举effective id，variable，workding dir等等。

source就是让script在当前shell内执行、而不是产生一个sub-shell来执行。由于所有执行结果均于当前shell内完成，若script的环境有所改变，当然也会改变当前环境了﹗
还记得改变了.bashrc 里面的设定后，要source .bashrc。大概就是这个意思吧。

6.4 exct和source/fork的差别

exec也是让script在同一个行程上执行，但是原有行程则被结束了。也就是简而言之：原有行程会否终止，就是exec与source/fork的最大差异了。

7. ( ) 与 { } 差在哪？

“命令群组”（command group）是将多个命令集中处理。
（）与{ }这两对符号都可将多个命令作群组化处理。
( ) 将command group置于sub-shell去执行，也称nested sub-shell，所作的修改是临时的，且不想影响原有或以后的设定。
{ } 则是在同一个shell内完成，也称为non-named command group

function，就是用一个名字去命名一个command group，然后再调用这个名字去执行command group。
在shell操作中，需要不断的重覆执行某些命令，我们首先想到的，或许是将命令写成命令脚本（shell script）。不过，我们也可以写成function，然后在command line中打上function_name就可当一舨的script来使用了。我们可以自行定义许许多多好用的function，再集中写在特定文件中，然后，在其他的script中用source将它们加载并反复执行。

第11问以后：
https://segmentfault.com/a/1190000004325734?utm_source=sf-similar-article