BZOJ-3256: 基因序列相似性问题(KMP+DP)
2018-10-17 本文已影响1人
AmadeusChan
题目:http://www.lydsy.com/JudgeOnline/problem.php?id=3256
裸裸的最长公共子序列问题,f( i , j , k )表示X匹配到i,Y匹配到j,P匹配到k的最长公共子序列,然后k用KMP维护就可以了。
代码:
#include <cstdio>
#include <algorithm>
#include <cstring>
using namespace std ;
#define update( i , j , k , f ) dp[ i ][ j ][ k ] = max( dp[ i ][ j ][ k ] , f )
#define MAXN 210
char s1[ MAXN ] , s2[ MAXN ] , s3[ MAXN ] ;
int dp[ MAXN ][ MAXN ][ MAXN ] , n , m , p , pre[ MAXN ] ;
int main( ) {
scanf( "%d%d%d" , &n , &m , &p ) ;
scanf( "%s%s%s" , s1 + 1 , s2 + 1 , s3 + 1 ) ;
memset( dp , 0 , sizeof( dp ) ) ;
pre[ 1 ] = 0 ;
for ( int i = 1 , j = 0 ; i ++ < p ; ) {
for ( ; j && s3[ j + 1 ] != s3[ i ] ; j = pre[ j ] ) ;
if ( s3[ j + 1 ] == s3[ i ] ) ++ j ;
pre[ i ] = j ;
}
dp[ 0 ][ 0 ][ 0 ] = 1 ;
for ( int i = 0 ; i <= n ; ++ i ) {
for ( int j = 0 ; j <= m ; ++ j ) {
for ( int k = 0 ; k < p ; ++ k ) {
if ( dp[ i ][ j ][ k ] ) {
if ( i < n && j < m && s1[ i + 1 ] == s2[ j + 1 ] ) {
int h = k ;
for ( ; h && s3[ h + 1 ] != s1[ i + 1 ] ; h = pre[ h ] ) ;
if ( s3[ h + 1 ] == s1[ i + 1 ] ) ++ h ;
if ( h < p ) update( i + 1 , j + 1 , h , dp[ i ][ j ][ k ] + 1 ) ;
}
if ( i < n ) update( i + 1 , j , k , dp[ i ][ j ][ k ] ) ;
if ( j < m ) update( i , j + 1 , k , dp[ i ][ j ][ k ] ) ;
}
}
}
}
int ans = 0 ;
for ( int i = 0 ; i < p ; ++ i ) ans = max( ans , dp[ n ][ m ][ i ] ) ;
printf( "%d\n" , ans - 1 ) ;
return 0 ;
}