转录组简介

        转录组即特定组织或细胞在某一功能状态下所有转录本的总和，包括 mRNA 和非编码 RNA（即Non-coding RNA，如 tRNA，rRNAs，microRNAs，piRNAs 和 long ncRNAs 等）。转录组测序 (Transcriptome sequencing) 主要指通过高通量测序研究特定组织或细胞在某个时期转录出来的 mRNA，可以用来研究基因结构和基因定量分析，并预测新转录本，是深入研究转录组复杂性的强大手段和工具。目前，转录组测序已经被广泛应用于动植物发育阶段的研究、优良品种基因的筛选和疾病治疗等。

一、真核转录组分为有参和无参两种；真核生物mRNA具有polyA的结构，直接利用oligoT将mRNA纯化出来。

DNA分为编码区和非编码区，真核细胞编码区又分为外显子和内含子；非编码区与基因的表达有关，包括启动子和终止子等。

真核细胞编码区的内含子外显子都会转录形成最初的信使RNA，然后再经过加工，把内含子转录形成的RNA片段剪切掉，将外显子转录形成的RNA片段连接在一起，形成的才是成熟的RNA，再用该RNA进行翻译合成蛋白质。 一条未经剪接的RNA，含有的多种外显子被剪成的不同组合，可转译出不同的蛋白质。就能将同一基因中的外显子以不同的组合方式来表现，使一个基因在不同时间、不同环境中能够制造出不同的蛋白质（基因表达调控），可增加生理状况下系统的复杂性或适应性。

可变剪切类型：http://www.360doc.com/content/17/1127/21/19913717_707706034.shtml

二、原核转录组只有有参，因为原核生物的mRNA一般为多顺反子（一段mRNA序列翻译多个蛋白），直接拼接效果较差。在原核生物中，mRNA只占全部RNA的1-5%，其余绝大部分是核糖体RNA（rRNA），最主要的方式是去除total RNA中rRNA（Ribo-Zero试剂盒）。

转录组技术在生物学中的应用：

快速获得生物体内的mRNA种类及其丰度，帮助您发现由于可变剪接或者可变多聚腺苷化位点选择所产生的新mRNA isoforms；

分析mRNA的差异表达信息，通过差异表达基因功能分析，可以发现在细胞分化，特别是胚胎干细胞和神经干细胞分化，机体发育，信号转导等生物学过程中基因表达调控改变的整体特征。

转录组技术在医学中的应用：

在癌变和其他复杂疾病发生和发展过程中，细胞内的基因表达模式会发生显著改变，在疾病的预防与治疗有显著的成果。

获得物种或者组织的转录本信息；得到转录本上基因的相关信息，如：基因结构，功能等；发现新的基因；基因结构优化；发现可变剪切；发现基因融合。