零代码合并TCGA表达谱数据
2021-03-07 本文已影响0人
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前面给大家介绍了☞如何使用R代码来合并TCGA数据库下载得到的RNAseq和miRNA seq的表达谱数据☜。没有太多R基础的小伙伴可能觉得理解起来和操作起来都有些困难。我就想得到一个表达矩阵，为什么这么难？既然你只关心结果，而不太注重过程。那么小编就给你做一个“黑盒子”，你不需要知道里面是什么，我给你输入，你给我输出就可以了。
这个“黑盒子”就是前面我给大家介绍过的☞Shiny-R语言轻松开发交互式web应用☜。其实他也并非是一个黑盒子，你要真想一探究竟，也是可以轻松找到源代码的，其实就跟我们在☞如何使用R代码来合并TCGA数据库下载得到的RNAseq和miRNA seq的表达谱数据☜使用的R代码是一样的，只是这里多了一个GUI（graphic user interface，图形用户界面），鼠标点一点就可以轻松得到合并之后的表达矩阵了。对于实用主义者，那就just do it。
界面是这样的，比较简洁
使用起来也很傻瓜式，鼠标选择相应的参数。合并好的表达矩阵就会展现在右边，点击下面的download按钮就可以将结果保存到本地。是不是很方便。
我们可以得到，sample type文件，方便后面做差异表达分析。
当然最重要就是表达矩阵文件
为了方便大家理解和使用这个工具，我特地录制了一个教学视频
☞零代码合并TCGA表达谱数据☜
工具的下载地址如下☟☟☟
参考资料
