这个升级版神器一键打通 Cibersoft, MCP各种免疫浸润

简介

免疫浸润的分析方法有很多，我在之前也已介绍过。像 Cibersoft有网页版也有R语言版，没有R语言基础要去学其实是需要学习成本的。这里介绍一个完全不需要找人帮忙的网页分析工具。

有什么功能？

可以使用的免疫浸润分析算法包括 :

• [TIMER] 算法

• [CIBERSORT, ]https://doi.org/10.1038/nmeth.3337)

• [quanTIseq, ] https://doi.org/10.1186/s13073-019-0638-6)

• [xCell ]https://doi.org/10.1186/s13059-017-1349-1

• [MCPCounter]https://doi.org/10.1186/s13059-016-1070-5)

• [EPIC]https://doi.org/10.7554/eLife.26476)

上图

比较不同算法计算出的免疫细胞浸润的差异

image.png

计算各种算法计算出来的免疫浸润分数

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所有这些结果都包含excel表格数据，也就是你同时拥有了各种算法计算的能力。
我知道这样的工具分享出来以后，马上就会有人来抄袭，然后发布到其它公众号 。所以我选择用1RMB把这批人筛选出去。