记“GO功能注释”流程
2017-09-22 本文已影响0人
Hisaga
文章转载于 Original 2017-06-12 liuhui 生信百科
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所谓的 GO(gene ontology, 基因本体论),是生物学功能注释的一个标准词汇表术语(GO term),将基因的功能分为三部分:
基因执行的分子功能(Molecular Function)
基因所处的细胞组分(Cellular Component)
基因以及参与的生物学过程(Biological Process)
不同的 GO term 间的关系由三类:is_a、part_of和regulates
目前,GO 注释主要有两种方法:
(1)序列相似性比对(BLAST)
(2)结构域相似性比对(InterProScan)