WES 测序数据量估算方法

公众号：生信诊断所

WES数据量估算公式：测序深度 X 目标捕获区域长度（exon）/ 捕获效率

举例：假如要测100X，外显子长度为30M，某测序公司的捕获效率为50%
外显子探针应该就是：外显子长度30M x 2（人是二倍体）
那么就 = 100 X 30M X 2 / 50% = 12G
同理：想测300x数据就需要36G数据量，
对应到reads数就是：假设测序类型为：PE150，除以300 = 40M = 4x10⁷reads数
一般测序公司返回的数据都是测了多少reads数。