生信星球培训第五十二期

学习小组Day3笔记—我爱一朵向阳花

2020-04-12  本文已影响0人  我爱一朵向阳花

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1、查看服务器是多少位的: uname -a
2、下载:wget +下载链接

安装conda(miniconda)

$ wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
$ bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
$ source ~/.bashrc   #激活conda
$ conda #查看是否安装成功
 #添加镜像channel(清华)
$ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
$ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
$ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
$ conda config --set show_channel_urls yes  #显示安装的channel
#也可以手动添加镜像
$ vi ~/.condarc
#输入后保存:
channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
  - defaults

conda命令行

1、查看miniconda中的已有软件列表:conda list
2、搜索需要的软件:conda search +软件名
3、安装软件:conda install 软件名 -y
指定软件版本号:conda install 软件名=版本号 -y
注意-y是自动安装,不加-y时,要在安装过程中输入很多y。
4、卸载软件:conda remove 软件名 -y

conda environment

需要软件的不同版本时用,或解决软件版本之间的不兼容问题
1、查看当前conda已有环境:conda info --envs
2、创建conda环境:conda create -n 新环境名
-n Environment
指定新环境中python版本:conda create -n 新环境名 python=3.6

conda create 参数
3、激活已创建的conda环境:conda activate 新环境名
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