monocle画图中屏幕上的数据如何储存

1.问题描述：使用monocle的plot_genes_branched_heatmap命令，画出图

但是每一个cluster是哪些基因ID?

2.解决方法：画图命令增加“ return_heatmap = TRUE”。就会在屏幕上输出，每个基因对应的分支号，然后每一支挑一些有代表性的写一下。

3.拓展，在屏幕上复制太麻烦了，并且太多了，怎么办呢？使用“sink”命令，如下：

sink("a.txt")

plot_genes_branched_heatmap(HSMM[branch_gene], branch_point = 1, num_clusters = 6,cores = 8,return_heatmap=TRUE)

dev.off()

sink()

问题解决了！屏幕不会输出之前的信息，而全部储存到a.txt里面！在里面搜“annotation_row”，后面就是基因和cluster的信息！