2020-11-26单细胞测序上游实践一
2020-11-26 本文已影响0人
curleyc
主要是学习上游实践过程中比较
添加路径一定要完整（服务器上面添加配置解压好的cellranger的环境）
$ export PATH=/opt/cellranger-2.2.0:$PATH
结果分析 https://www.jianshu.com/p/e8b2b9a43cb3
质控之后结果解读https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/Help/3%20Analysis%20Modules/
https://www.cnblogs.com/jxlab-guorong/p/10248924.html很好
cellranger使用方法https://www.jianshu.com/p/5157ab9f6977
这个写的很好使用cellranger count:https://www.jianshu.com/p/08f75901cc3e
之后会来补充
