生信常用数据库（三）：SwissProt和TrEMBL数据库搭建

前言

    UniProt是信息最丰富、资源最广的蛋白质数据库，由两大部分组成，SwissProt和TrEMBL，SwissProt为高质量的、手工注释的、非冗余的数据集，TrEMBL包含未校验的、自动注释的条目，这两数据库在基因组注释中会常用到，尤其是高质量的SwissProt数据库。

下载

    选择Swiss-Prot和TrEMBL的fasta文件下载即可

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安装

    Swiss-Prot和TrEMBL数据库解压后用blast建立索引即可使用（blast软件添加环境变量）

gunzip uniprot_sprot.fasta.gz    #解压

makeblastdb -in uniprot_sprot.fasta -dbtype prot  #建索引

gunzip uniprot_trembl.fasta.gz   #解压

makeblastdb -in uniprot_trembl.fasta -dbtype prot  #建索引

    建完索引后可以直接用blast软件进行比对