顺式作用元件的认识、查找、分析,一tiao龙服务!

2020-03-12  本文已影响0人  种菜的小王

DNA顺式作用元件的认识、查找、分析,一tiao龙服务!

1.顺式作用元件的基础知识

① 顺式作用元件(cis-acting element)是什么?

 答:具有转录调节功能的,可影响自身基因表达活性的,较短的一段DNA序列。但是,需要注意的是,顺式作用元件在分子遗传学领域,相对同一染色体或者DNA分子而言为“顺式”,对不同染色体或者DNA分子而言为“反式”。

promoter简图

真核生物的转录调控是调控的最重要途径,大多是通过【顺式作用元件】和【反式作用因子】复杂的相互作用实现的。

② 顺式作用:cis-acting,蛋白质因子可以特异识别、结合自身基因的调节序列,调节自身基因的表达(DNA对DNA产生直接影响)。

③ 反式作用:trans-acting,由某一基因表达产生的蛋白质因子,通过与另一基因的特异的顺式作用元件相互作用,调节其表达(DNA通过其产物(mRNA或蛋白质)间接调节基因的表达)。

顺式/反式调节示意图

2. 顺式作用元件的查找

最常用、认可度最高的两个网站:

①PLANTCARE:http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/,具体步骤见下图:

PLANTCARE使用步骤

②PLACE:https://www.dna.affrc.go.jp/PLACE/?action=newplace

PLACE使用步骤

PLACE具体使用教程:点这里

3.顺式作用元件的分析

在看过的一些文章中,拿出一篇觉得还不错的中文文献和大家分享:

茶树脂氧合酶CsLOX3基因启动子的克隆及其顺式作用元件的分析,懒得搜名字下载可下方自取哈~

百度网盘链接:https://pan.baidu.com/s/1rzDAkEl9K-9fwAO3KcZ6TQ     提取码:h5sv

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