Nextflow Intro
2018-09-07 本文已影响54人
宇辰星君
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Nextflow
Nextflow是数据驱动的pipeline,使用软件容器实现可扩展、可复写,适应于大多数常见脚本语言,流畅的领域特定语言(DLS)简化了在云和集群上的部署和复杂并行工作流程的开发。
Groovy介绍
Nextflow doc
1.get started
2.基本概念
3.Pipeline script 语法格式
4.几个重要概念
- Processes
- Channels
- Operators
- Executors
- Configuration
5.高级管理
- 亚马逊云
- 亚马逊S3存储
- Conda环境
- Docker容器
- Singularity容器
- Apache lgnite
- Kubernetes
6.其他