SDTM:QRS域相关变量(CAT, TEST/CD)的命名规则

2022-04-12  本文已影响0人  野藤_

QRS指的是3方面内容,问卷调查(Questionnaires)、评分(Ratings)和量表(Scales )。在SDTMIGv3.3中,QRS的数据会呈现在FT、QS、RS这3个Domain中。

CDISC有专门的说明文档来介绍QRS域相关变量的命名规则,涉及到的变量为--CAT, --TESTCD, --TEST。这篇文章简单梳理这3个变量的命名规则,原文档参考QRS_Naming_Rules_2021-03-05.xlsx

QRS Naming Rules

我也补充介绍了--ORRES/--STRESC/N的Mapping。

文章第5部分,列举了CDISC提供的3个QRS数据集Mapping的aCRF案例。若想查看更多的aCRF实例,请参考CDISC网站QRS | CDISC

QRS Supplements

下面具体介绍3类变量的命名规则。

1. --CAT Rules

--CAT变量用于保存具体的QRS名称,可以是QRS的全称,也可以是全称的首字母缩写,内容要求大写。

如果使用缩写来表示名称,缩写内容长度应≤6,以便后续有足够的长度构建TESTCD变量

1.1 --CAT的取值可以是首字母缩写,也可以是全称,例如:

DAD (i.e. Disability Assessment for Dementia)

1.2 如果QRS包含多个版本,--CAT的取值也要包含版本号,例如:

  • APACHE II (i.e. Acute Physiology and Chronic Health Evaluation II)
  • FACT-HEP V4 (i.e. Functional Assessment of Cancer Therapy-Hepatobiliary Version 4)

1.3 如果QRS已知只有一个版本,--CAT取值应包含版本信息,例如:

HAUSER AMBULATION INDEX (no commonly known acronym hence full name of the assessment is used)

2. --TESTCD Rules

--TESTCD变量为QRS中具体问题的缩写,以--CAT变量取值的首字母缩写开头,后接问题的编号。变量长度为8,内容要求大写。

2.1 如果QRS中的问题不包含编号,则--TESTCD的取值使用从01开始的连续编号;如果问题包含编号,--TESTCD的取值应使用提供的编号。

a questionnaire with items numbered 1-23 on the CRF, should have --TESTCDs = xxxnn01 - xxxnn23.

2.2 如果已有编号的问题包含子问题,并且子问题为元问题的具体回答,子问题的--TESTCD取值需加字母后缀。具体讲,元问题对应的--ORRES取值为子问题名称;子问题对应的--ORRES取值为更具体的回答,例如:

  • Are you currently driving? (--TESTCD = VFQ0115)
    -- Never Driven or Given Up Driving (--TESTCD = VFQ0115A)
    -- Main Reason You Gave Up Driving (--TESTCD = VFQ0115B)

2.3 如果已有编号的问题包含的子问题层级相同,则所有子问题TESTCD的取值需加字母后缀,例如

How Intense is Your Deep Pain (--TESTCD = NPS0110A)
How Intense is Your Surface Pain (--TESTCD = NPS0110B)
(There is no --TESTCD for NPS0110)

2.4 如果问题是为了解释某个答案,就不需要放到--TESTCD中,需要保存到其他变量中(e.g., --STAT),例如:

  • Lacked support from your spouse or partner? (--TESTCD = PDQ0128)
    --If you do not have a spouse or partner check here (QSSTAT)

2.5 如果问题编号中含有小数点.,使用下划线_替代,例如:

Does [name] only moan, groan or make other sounds that are not understandable? (--TESTCD = ED102_5)

3. --TEST Rules

--TEST 变量保存QRS问题的简洁描述,以--CAT变量取值的首字母缩写开头,后接连字符-,连字符之后接问题的具体描述

3.1 --TEST变量大小写格式

--TEST 变量中连字符后面的内容采用标题大小写的格式(Title case)。

标题大小写的格式是,除了冠词、连词和3个字母或更少的介词外,每个单词的首字母都要大写

动词需要首字母大写:

Is, Was, Were, Are

以下单词需要小写:

a, an, and, as, at, but, by, for, in, nor, of, on, or, per, to, the.

DAD01-Decide to Wash

有些介词可能用作为形容词或副词,也需要首字母大写:

  • "on" in "The On Button"
  • "to" in "Come To"

有些介词作为拉丁语表达的一部分,也作形容词或副词使用:

  • De Facto
  • In Vitro

对于包含连字符的词语,如果第一位是单词,那么第一个单词首字母大写,后面单词小写;如果第一位是数字,后面单词首字母大写。举例如下:

  • Self-conscious
  • 3-Day
3.2 --TEST变量的长度控制

--TEST变量长度为40,为了不超过长度限制,接连字符-之后的内容可能需要缩减。常用的缩写方式,有以下几种。

使用斜杠/代替or

CSS04-Preparatory Acts/Behav, Descr

使用"w/"来代替 with(斜杠之后无空格):

DDS01-Too Much Diabetes Equipment w/Me

使用"w/o"来代替 without:

FAC075-Able to Pay Attention w/o Effort

使用"&"来代替 and:

4. --ORRES/--STRESC/N 归纳

文档中没有--ORRES/--STRESC/N这3类变量具体Mapping的说明,我归纳总结了一下。这3个变量保存QRS问题的具体回答,主要有以下几种情况:

  1. 数值结果
  2. 带有编号的具体文字内容
  3. 不带有编号的具体文字内容
4.1 数值结果

--ORRES/--STRESC/N,3类变量全部保存具体的数值。这里补充一点,在ADaM中,基于分析的需求,数值结果会保存到AVAL变量中,对应AVALC变量会置空

4.2 带编号的具体文字内容

--ORRES变量保存具体的文字内容;--STRESC/N变量保存对应的编号。

4.3 不带编号的具体文字内容

--ORRES变量保存具体的文字内容;--STRESC/N看具体情况进行赋值。

例如,--ORRES取值为Yes/No,对应的--STRESC会Mapping成Y/N。如果--ORRES为具体的自由文本,--STRESC的内容就会与--ORRES保持一致。需要注意,有的公司或项目会要求--STRESC内容大写。

具体可以参考下面几个aCRF实例。

5. Annotated CRF演示

以上是QRS域相关变量的命名规则,CDSIC网站发布一些QRS数据集相关的aCRF举例。这里分享几个案例,希望帮助大家理解上面介绍的命名规则。

若想查看更多的aCRF实例,请参考CDISC网站QRS | CDISC

5.1 QS Domain,AQ20 RESPIRATORY QUESTIONNAIRE,AQ20呼吸问卷
QS aCRF QS SDTM 1 QS SDTM 2
5..2 FT Domain, 10-Meter Walk/Run, 10米走/跑
FT aCRF SDTM FT 1 SDTM FT 2
5..3 RS Domain, Abnormal Involuntary Movement Scale, 异常不自主运动量表
RS aCRF RS SDTM 1 RS SDTM 2 RS SDTM 3

总结

这篇文章介绍了QRS域相关变量(CAT, TEST/CD)的命名规则,也列举了3例CDISC的aCRF的Mapping,希望帮助大家理解QRS相关内容的SDTM Mapping。

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