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儿童节礼物!常用水稻数据库及生信在线平台总结

2020-06-01  本文已影响0人  瓶瓶瓶平平

儿童节嘛,就稍微用我与儿童一致的粗浅学识总结一下


水稻表达谱数据库1 efp(非常全面):
http://bar.utoronto.ca/efp_rice/cgi-bin/efpWeb.cgi

1591018509(1).png
水稻表达谱数据库2 ic4r(共表达与pathway查找):
http://expression.ic4r.org/
图片.png

水稻pathway及network数据库:
http://bis.zju.edu.cn/ricenetdb/documentation.php

1591018833(1).png

RIGW(MH63与ZS97的库):
http://rice.hzau.edu.cn/rice/

1591018954(1).png

MBKbase(R498库; 同时有大量分子育种学内容):
http://www.mbkbase.org/

1591019137(1).png

RAP与MSU(这两个大家都知道就不放图了):
https://rapdb.dna.affrc.go.jp/
http://rice.plantbiology.msu.edu/

还有即将要上线的HJX74 SSSLs database!!(网址待定)


国家水稻中心数据库(功能收录):
http://www.ricedata.cn/gene/

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funRiceGenes(水稻功能基因及基因家族归类):
https://funricegenes.github.io/

图片.png

还有一个是panther,虽然他不是专业对水稻的,但是他的对水稻的Go-slim注释真的非常友好,无论RAP还是MSU的识别率都非常高。
http://www.pantherdb.org/

图片.png

部分数据库功能重叠严重,但更多的时候却是功能或数据互补的关系!只有善于利用才能挖掘出想要的数据!
祝大家儿童节快乐!!

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