Li 1 初次接触linux

我第一次接触linux，非常地陌生，甚至觉得自己对linux为负基础，赶紧在网上搜了一下什么是linux

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无论从知乎或百度，还是维基上搜索到那些关于linux的文字介绍，对我这个初学者来说一头雾水，不理解，而且很排斥。但是要想学好生信，必须掌握linux，我在生信技能树（http://www.bio-info-trainee.com/1661.html）以及清华大学（https://lulab2.gitbook.io/teaching/part-i.-basic-tools/1.linux）
网站上发布的內容，生信技能树的Jimmy说，现在不理解，但是坚持学下去，到时候回过头来看看现在不理解的，也许以后就能理解了。我把生信技能树里Jimmy对linux讲解的课程视频（https://www.bilibili.com/video/av28813815?from=search&seid=3524704600014258872）学习。
每天无论学到或是接触到多少的linux知识，都记录下来：
Linux是黑白可视化命令函

Linux的常用命令

• dirs 显示目录记录
• rmdir删除空目录
• mkdir创建目录
• rm删除给定的文件和目录
• pwd绝对路径方式显示用户当前工作目录
• ls显示目录内容列表（001 2:26）
• mv用来对文件或目录重新命名
• cp将原文件或目录复制到目标或目录中
• cd切换用户当前工作目录
• touch生成一个空文件或更改文件的时间
• In建立链接文件
• find查找文件
• file/stat查看文件类型或文件属性信息
• echo 把内容重定向到指定的文件中

Linux文件命令

• cat查看文件内容
• head查看文件前几行
• tail查看结尾几行
• touch创建文件
• find查找文件（夹）
• diff查看两个文件是否有差异
• rename重命名
• less分屏上下翻页浏览文件内容
• more显示文件内容，每次显示一屏
• wc统计文件中字节数
• cp复制文件

通配符

*代表任意（0到多个）字符 eg *.fastq
？代表任意1个字符. ???.sh
$变量前需要加的字符
{}命令区块组合或者内容序列 mdir2016_{a…z}

表格化操作（要求文本文件非常规范）

• cut 显示行中的指定部分，删除文件中指定子字段
• tr 对来自标准输入的字符进行替换，压缩和删除
• sort 将文本文件内容进行排序
• uniq 报告或忽略文件中的重复行
• paste 合并多个文件（按行）

三驾马车

• grep 查找文件中符合条件的行
• awk对特定的行中特定列进行操作
• sed文本处理并可对文件进行操作

环境变量

• linux是一个多用户的操作系统，多用户意味着每个用户登录系统后，都有自己专用的运行环境。

善用小技巧

• tab键 补全命令
• history 查看历史命令
• alias 写入配置历史命令
• conda 管理不同环境
• zsh 提高效率