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安捷伦芯片下载及标准化流程(agilent)

2019-11-24  本文已影响0人  柳叶刀与小鼠标

标准化以前:

标准化中:

标准化以后:

首先下载原始数据,而不是上传的mtrix文件

我们这里使用的是单通道的agilent芯片标准化流程,双通道的会相对简单一些

所使用的测序是GPL19978, 测序平台Agilent-069978 Arraystar Human CircRNA microarray V1
所使用的数据集是GSE78520,数据集定义:使用高度敏感的cricRNA阵列,筛选了在人肝癌和邻近正常肝组织中的13617个circRNA,并通过生物信息学分析了差异表达的circRAN的功能。

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