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本文是根据中国农大丁向东教授汇报进行了总结。

0 提纲

其主要从一下几个方面进行讲解：

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1 导言

目前处于规模化的现代养殖时代。 猪肉在我国占据主要地位，并且我国猪业目前处于转型阶段

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动物育种的阶段：

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作物育种的阶段：其更早的进入设计育种阶段，且我国也在世界的并行水平

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2 GS的作用

2.1 GS简介

基本理论基础：SNP与基因处于连锁不平衡，查看GEBV

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2.2 动植物GS的基本方法

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2.3 GS的优势

其中，个人认为不能全部捕获基因组中的全部遗传变异，至少目前还很难做到。

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动物中，奶牛最先开始GS
美国奶牛的GS，测量的总数已经超过了300M，得到结果也使公牛的父亲年龄大大降低（降低世代间隔）

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效益：

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我国奶牛GS研究

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我国猪GS应用

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PIC的应用

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PIC做GS的应用价值评估

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我国猪GS联合育种

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GS的准确性：

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终选EBV与早期GEBV秩相关（查看排名）：

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后裔测定验证结果：

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3 我国猪GS的进展

3.1 国家生猪改良计划（2009-2020）

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2017年国家猪基因组选择计划开展

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GS实施的核心问题

参考群体构建
使用估计算法
搭建育种平台
基因型测定

3.2 进展1：参考群构建

针对我国多品系来源的情况，丁向东教授等提出构建混合群体构建参考群体

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发布了猪GS联合的遗传估计报告

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3.3 GS遗传评价估计计算程序和育种评价

具有我国自主产权的估计软件

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3.4 SNP高通量分型技术

SNP芯片技术和测序技术，以50K SNP为主

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国产芯片的研发：

基于靶向捕获测序技术研发，价格低，全部国产化。

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开发思路

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评价：

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芯片兼容:

以基因型填充进行解决，但是合并填充不好，需要单独作为参考进行填充。

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效果：

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4 GS实施的问题和对策

4.1 GS实施的关键点

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4.2 困难

芯片价格高和检测数据慢

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4.3 解决

先低（10K）后高密度（40K）检测，

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具体案例

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优势

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参考群体需要不断更新
加快遗传进展：

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增加收入，矫正系谱。

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GS费用和效果简单预测

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4.4 建议

需要不断实施，真是使用GS

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5 问题

1）10K芯片设计考虑的问题
芯片设计： 均匀分布在染色体，着丝粒两端， SNP落到QTL上，用于液相芯片。

2）GS会加快近交？
GS选择的群体较大，根据芯片数据进行基因组选配。大群体进行检测芯片数据，有较大的选择余地。

3） 国家种猪数据库的作用
对国家育种体系较好，长期收集表型和系谱数据。繁殖数据300W，发布国家种猪估计报告。
进入GS后，可以对所有的猪进行估计。企业做的工作需要更进一步进行。
4） 10K填充为50K
可以直接进行遗传评估，查看后代的成绩进行比较。育种值得平均值进行表型。上下代的选择指数进行比较。

5）动植物育种应相互借鉴，尤其是表型测定。