直接原位PCR(In situ PCR)

2018-07-16  本文已影响164人  7aabdaa41cae

原位PCR是原位杂交细胞定位和PCR的高灵敏度相结合的技术,使得靶基因检测有了极大的改进。此技术是在细胞(爬片、甩片或涂片)或组织(石蜡、冰冻切片)上直接对靶基因片段进行扩增,通过掺入标记基团直接显色或结合原位杂交进行检测的方法。

一、组织切片和细胞样品的制备

试剂与配置

10%福尔马林;二甲苯;PBS

操作方法

1. 用10%福尔马林固定组织8~15hr,石蜡包埋,切片(4μm),将切片置于新鲜的二甲苯中处理5min,放入无水乙醇中浸泡5min,取出,空气干燥;

2. 对于培养细胞,可直接制备爬片,也可有PBS洗细胞一次,加10%福尔马林静置过夜,用橡胶刮下细胞;用PBS洗细胞两次,2000rpm×3min,用5ml PBS重悬细胞,即可用甩片机甩片或直接吸50μl点在载玻片上。

二、切片预处理(蛋白酶消化)

试剂与配置

0.1mol/L Tris-HCl (pH7.4)

缓冲液A:0.1mol/L Tris-HCl

(pH7.4),0.3% Tween-20,0.5%NP-40

蛋白酶K:20-50μg/ml,溶于TE中

操作方法

1. 干燥后的切片置于0.1mol/L

Tris-HCl (pH7.4)中,室温孵育5min;

2. 浸入缓冲液A中,室温孵育10min;

3. 滴加20μl蛋白酶K液于标本上,在湿盒中37℃孵育20min;

4. 在室温下,用0.1mol/L

Tris-HCl (pH7.4)漂洗两次,每次5min。

三、原位扩增(以标记生物素为例)

试剂与配置

PCR反应缓冲液:两种引物各100pmol,dATP、dCTP、dGTP和dTTP各200μmol, Bio-dUTP 50mol,1×PCR缓冲液;

Tag酶:5U/μl

缓冲液B:0.01mol/L PBS,0.1% Triton-X100

指甲油(市售)

无水乙醇

操作方法

1. 切片用1×PCR缓冲液平衡3次,每次5min;

2. 用滤纸吸去切片上多余的液体,置60℃,每片加入30μl PCR反应缓冲液,5U Tag酶,用盖玻片封片,四周封以指甲油,防止蒸发;

3. 94℃变性5min,按下列条件(94℃×2min,55℃×2min,72℃×3min)循环20~25次后,72℃延伸5min;

4. 玻片浸入无水乙醇中10min,以软化指甲油;

5. 用刀片撬开盖玻片并除去;

6. 用缓冲液B漂洗两次,每次3min;

7. 用无水乙醇固定5min,并吹干。

四、检测(以ABC法为例)

试剂与配置

缓冲液C:0.1mol/L Tris-HCl

(pH7.5),0.1mol/LNaCl,2mmol/LMgCl2,0.5% Triton-X100

封闭液:3%BSA(溶于缓冲液C中)

显色液:0.05%DAB,溶于0.05mol/L

Tris-HCl (pH7.4),临用前每10ml加30%过氧化氢50μl

1%盐酸酒精液

苏木素染色液

操作方法

1. 用30μl 3%BSA滴加在玻片上,封闭1hr;

2. 用缓冲液C简洗1min,每片滴加ABC复合物20~30μl,室温放置40min;

3. 缓冲液B室温漂洗3次,每次15min;

4. 滴加显色液于玻片上,镜下观察控制显色时间(一般7~14min);

5. 流水洗片,浸入苏木素液中复染30s,1%盐酸酒精分化(提抽2次);

6. 常规脱水、透明、封片,镜下观察。

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