研究结果

1植物与动物协同进化：组装得到的榕树基因组423Mb，对叶榕大小是359Mb。比较分析发现，2者分化于40百万年前。而榕小蜂（榕树的寄生蜂）的基因组大小是387Mb，之前有研究已经发表了大果榕小蜂（对叶榕的寄生蜂）的基因组，因此2者的基因组比较分析发现分化于41.5百万年前，与前面2种榕树的分化时间很接近！而且，它们的基因都显示出一些共性特征，显示出趋同进化，这就有意思了啦。
2 气生根形成：气生根中高表达基因在一系列与运输相关的生物过程中显著富集。在气生根中发现大量的IAA在榕树气生根部位(15.65 ng / g），与其叶子部位(3.11 ng / g)和对叶榕叶子部位(3.38 ng / g)相比,超过5倍增量,这表明增加生长素含量能促进气生根发展。本研究认为光促进的生长素依赖途径与气生根的起始、生长和模式形成相关，这也为榕树气生根特征进化和相关园艺品种开发提供了重要理论基础。
3 性染色体进化和性别决定：Chr12的第一个~ 2Mb的非重组区被鉴定为性别决定区。利用phased技术组装了XY性染色体，X染色体和Y染色体之间的比较揭示了大量的序列差异，使我们在Fh中发现位于Y染色体0.61 - 1.57 Mb之间的反转抑制重组区域。用转录组技术鉴定到一个蛋白编码基因Fh.12G0000020强烈表达，分析表明这个基因是影响性别决定的主导因素。这个基因属于MADS-box基因家族。

phased是啥技术？
直系同源vs旁系同源

4 榕属的起源和进化：用ML建树与之前研究基本吻合。杂合和遗传亲缘分析表明，Oreosycea在两个分支上不同的系统发育位置出现了渐渗现象，这可能解释了药草亚属在两个分支上出现的原因。本研究分析显示，雌雄同株代表了该属的祖先生殖系统。分子定年分析显示，雌雄同株和异株的分化发生在始新世(约47.5千万年)，此时二氧化碳含量高且全球变暖。