生信学习小组80期 Day3-CM

今天学习的内容是学会如何使用conda命令在服务器上安装相应的软件

安装miniconda

安装前使用uname -a命令先看下自己的版本

查看版本.png

wget下载相应版本的miniconda

miniconda的下载.png

使用bash实现miniconda的安装

bash安装.png

激活miniconda

成功激活miniconda.png

添加镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

conda的使用

1.使用conda list查看已安装的软件

conda list查看软件.png

2.搜索conda软件

conda search fastqc 搜索fastqc软件

搜索fastqc软件.png

3.安装fastqc

conda install fastqc -y

fastqc的安装.png

4.卸载已安装的软件

conda remove fastqc -y