有了这些神器，我挥手就是一批课题

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在我们实验室有一个说法：看文献就像逛淘宝，总有一天你能挖到宝。对于科研工作者来说，这个宝莫过于课题和科研神器。还别说，笔者今天还真挖到了几个不错的科研神器，下面为大家分享一下。

笔者今天拜读的这篇文章于5月7日发表在European Journal of Pharmacology杂志上，影响因子为3.04，通讯单位是广西医科大学第一附属医院。

这篇文章讲述的是MicroRNA-486-5p通过靶向PTEN来抑制冠状动脉微栓塞诱导的心肌细胞凋亡，具体研究内容我就不细讲了，主要来看看本文的科研神器。在文章中，作者明确指出，通过TargetScan7.1, miRanda和mirbase三个网站来预测miR-486-5p的靶点为PTEN，后续研究也以此而展开，我在这里给大家讲讲这三个科研神器的用法。

1. TargetScan7.1

网址为http://www.targetscan.org/vert_71/。进入首页后，可以看到该网站的一些信息，比如7.1网页版于2016年6月投入使用，最新可用的版本是7.2，此外该网站是一个预测哺乳动物中microRNA靶标的网站。

在下方就是预测界面了：

1区域是选择需要预测的物种，目前该网站提供10个物种，这里选择了网站默认的human；

2区域是基因名称输入栏，其主要功能是知道靶基因，预测靶基因的microRNA；

3区域是microRNA选择区，既可以根据microRNA不同类型进行选择，也可以直接输入microRNA名称来预测靶基因，比如在这里我输入网站提供的miR-9-5p。

点击submit，进入搜索结果页面，可以看到，该网站预测了很多miR-9-5p的靶基因。

2. miRanda

网址为http://www.microrna.org/microrna/home.do。进入该网站，可以看到页面很简明。miRanda这个网站是研究microRNA比较早期的一个数据库，早在2010年就被开发应用。在miRNA搜索栏中输入待查询的microRNA，这里我们输入网站提供的范例let-7a；随后是物种选择，该网站目前仅提供5个物种，这里我们选择默认的homo sapiens。

点击Go进行搜索，可以看到根据该网站预测let-7a的靶基因有5436个，点击links栏中的view targets获取靶基因信息。

在刷新的页面中可以看到靶基因的具体信息以及mirSVR score，该分数越小，表示此靶基因的概率越大。

3. mirbase

网址为http://www.mirbase.org/。进入网站后，搜索界面位于右上角，当前应用的是2018年10月更新的22.1版本，该数据库总共包含38000多个miRNA，是一个很全面的miRNA查询数据库。在搜索栏中同样需要输入microRNA的名称，这里我输入网站自带的范例mir-181a。

输入后，点击Go，在页面中会出现多种不同物种的microRNA信息，这主要是因为我们在输入microRNA时没有加上种属信息，这里我们选择人源的hsa-mir-181a-2。

点击Accession号MI0000269，待刷新后可以看到hsa-mir-181a两种不同的成熟体形式，分别为5p和3p。在靶标预测栏目中，可以看到链接了四个microRNA靶标预测网站，点击任意一个网站就能获得hsa-mir-181a的预测靶基因。

可以看到，有了这三个microRNA靶蛋白预测神器，我们就可以轻松的找到课题思路和机制，文章题目都想好了，直接是MicroRNA XXX靶向YYY蛋白来调控功能。这种3+文章套路真的不是个例，笔者稍微查询一下就看到了很多类似的文章，比如下面这篇5月10日发表在Cancer Medicine的文章基本也用到了相同的套路。

而且在该文章中，作者也明确指出通过TargetScan网站预测miR-4286的靶基因。

是不是很强大，科研同行们，有了这几个神器，课题分分钟就能活化，还不赶紧试一试。

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