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NAR 2019数据库总结——2StrucCompare

2019-07-07  本文已影响17人  drlee_fc74

2StrucCompare分为两个功能:2Struc用来可视化一个蛋白序列的结果。2StrucCompare用来比较两个蛋白数据的结构。 这个数据库使用了四种不同的的算法来计算蛋白的结果。分别是DSSP; Stride; P-SEA; STICK

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2Struc

2Struc数据库接受两种输入方式:PBD格式的文件上传以及PBD数据库内的ID号

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主要结果包括三部分:

  1. 蛋白序列方面的总结:其中包括总体的总结以及我们想要观察局部的总结

  2. 蛋白序列序列的简单可视化

  3. 蛋白序列的三维结构

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2StrucCompare

2Struc数据库同样也接受两种输入方式:PBD格式的文件上传以及PBD数据库内的ID号。由于是蛋白结构的对比。所以输入的是两个蛋白序列。

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结果也和单个的相似。只是说两个蛋白序列的对比。尤其是在3D可视化方面,是把两个蛋白序列结合到其实查看的。

如下图,在三维图里面,灰色和白色就代表两个不同的蛋白。

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PS:网址上所有分析结果都是可以下载下来的。其中也可以包括序列图和三维的图。

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