NAR 2019数据库总结——2StrucCompare
2019-07-07 本文已影响17人
drlee_fc74
2StrucCompare分为两个功能:
2Struc用来可视化一个蛋白序列的结果。2StrucCompare用来比较两个蛋白数据的结构。 这个数据库使用了四种不同的的算法来计算蛋白的结果。分别是DSSP;Stride;P-SEA;STICK
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2Struc
2Struc数据库接受两种输入方式:PBD格式的文件上传以及PBD数据库内的ID号
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主要结果包括三部分:
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蛋白序列方面的总结:其中包括总体的总结以及我们想要观察局部的总结
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蛋白序列序列的简单可视化
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蛋白序列的三维结构
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2StrucCompare
2Struc数据库同样也接受两种输入方式:PBD格式的文件上传以及PBD数据库内的ID号。由于是蛋白结构的对比。所以输入的是两个蛋白序列。
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结果也和单个的相似。只是说两个蛋白序列的对比。尤其是在3D可视化方面,是把两个蛋白序列结合到其实查看的。
如下图,在三维图里面,灰色和白色就代表两个不同的蛋白。
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PS:网址上所有分析结果都是可以下载下来的。其中也可以包括序列图和三维的图。