基于dpabi的对FMRI的atlas的数据的提取

BG

在很很多时候，在对FMRI建立网络的时候，很多时候都是需要预先定义好ROI然后计算功能连接，所以在提取ROI的时候，就需要对模版图像进行处理。

Workflow

• 1 利用Dpabi的image reslice 功能，对模版进行重新采样。
• 2 利用MASK对大脑进行分区时间序列的提取，FMRI是4D数据，笨法子就一层一层按ROI进行提取，然后在合并，但是这种效率比较读，相对而言，进行Reshape就比较快，只需要将前三维展开成一维的 ，最后成2维的数据即可进行提取，具体的matlab代码如下。以power 264的alta为例子。

    fmridata=y_ReadAll(combineName);##读取FMRI data
    [a,b,c,d]=size(fmridata);
    if(d==490）##统一时间序列长度
        fmridataTran=reshape(fmridata,[],size(fmridata,4));
        slide264=zeros(264,490);
  for j=1:264   
       % j=1;
        roi1=find(atlasdata==j);
        slide264(j,:)=mean(fmridataTran(roi1,:));
    end