rna_seq

诊断性meta研究(后附stata代码)

2020-06-09  本文已影响0人  养猪场小老板

1、首先从感兴趣的文章四格表资料中,按如下图片格式提取相关数据到excel中

文献中的四格表 数据提取格式

2、诊断试验meta的文献质量评估工具

评估方法

可以参考Revman中的评价或者去官网下载表格对照文献评价

3、最好还是用STATA软件

1)将提取的数据复制到stata中
复制数据
2)复制数据的代码,将第一行作为变量名
复制结果
3)stata操作的代码
##先安装midas,所有命令可直接粘贴复制回车到命令框内
##help midas  上面有很多可以用到的命令
ssc install midas
#1)对研究结果进行总结
midas tp fp fn tn,es(x) res(all)
#2)绘制敏感度和特异度森林图
midas tp fp fn tn,id(author) year(year) es(x) ms(0.75) ford for(dss) texts(0.80)
#第二种
midas tp fp fn tn, id(author year) ms(0.75) ford fors bfor(dss)
#3)绘制Fagan图
##显示验前概率、似然比和验后概率的关系
##括号里填的是验前概率,可以按自己需要修改
midas tp fp fn tn,es(x) fagan prior(0.50)
#4)绘制SROC曲线
midas tp fp fn tn,es(x) plot sroc2
#5)绘制漏斗图
midas tp fp fn tn,pubbias
###stata的图如果不满意,还可以自己编辑
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