生物信息学

效能检验(power analysis)

2020-04-13  本文已影响0人  吴十三和小可爱的札记

简介

在备择假设为真的情况下,统计效能为达到统计显著性的可能性大小。换句话说,统计效能指在给定样本量和效应量(相关性大小,差异性大小)的条件下获得小于0.005(0.001)的P值的可能性大小。一般来说,当样本量越小时,统计效应量应该越大才能达到统计显著性。

上述四个变量具有很强的相互关系,已知其中三个就可求得的另一个:

R语言中的效能分析

pwr包Stéphane Champely写的关于效能分析的包,通过[github]{https://github.com/heliosdrm/pwr}或者Statistical Power Analysis for the Behavioral Sciences (2nd Edition) by Jacob Cohen获得更多信息。

主要函数

FUNCTION POWER CALCULATIONS FOR
pwr.2p.test two proportions (equal n)
pwr.2p2n.test two proportions (unequal n)
pwr.anova.test balanced one way ANOVA
pwr.chisq.test chi-square test
pwr.f2.test general linear model
pwr.p.test proportion (one sample)
pwr.r.test correlation
pwr.t.test t-tests (one sample, 2 sample, paired)
pwr.t2n.test t-test (two samples with unequal n)

stats包也有常用的基础效能分析函数,power()、power.t.test()、power.prop.test()、power.anova.test()。

应用函数

主要参考:https://www.statmethods.net/stats/power.html

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