最新8+ 单基因泛癌+实验验证，不过时的万金油套路

影响因子：8.7

关于单基因泛癌分析，我们已经介绍了很多。我们的客户也发了数篇7分+的文章，只不过由于保密的原因，我们不会进行宣传，只能讲解别人发的文章。
小编最近也筛选到一些结果比较好的基因，需要做深入分析的可以联系小编喔。

生信分析咨询

请关注生信小课堂，全网同名

研究概述
近年来，全球癌症患者的死亡率呈现出明显的增长趋势。目前，泛癌研究已广泛用于识别肿瘤分子标志物和信号通路，以更全面深入地了解肿瘤发生和发展的分子机制。AHSA1是热休克蛋白90（Hsp90）唯一的ATP酶激活剂，在调节Hsp90的分子伴侣循环和蛋白质折叠中起关键作用，可以促进一些癌症相关蛋白质的折叠、成熟和转运，并介导肿瘤细胞发生侵袭、增殖和凋亡等。在这项研究中，作者分析了AHSA1在泛癌中的异常表达，探讨了AHSA1表达与肿瘤预后、免疫细胞浸润、肿瘤突变负荷（TMB）、微卫星不稳定性（MSI）及多种通路相关分子之间可能存在的关联，并结合细胞和组织标本验证了AHSA1在肝细胞癌中的表达和潜在功能。

研究结果
一、AHSA1在泛癌中的表达
**1、根据TCGA数据库中33种肿瘤的RNA-seq数据评估AHSA1在泛癌中的mRNA表达。结果显示，AHSA1在正常胆管组织中的表达水平较低，而在睾丸生殖细胞肿瘤组织中的表达水平较高。与相应的癌旁组织相比，AHSA1在BLCA、BRCA、CHOL、COAD、ESCA、HNSC、KICH、LIHC、LUAD、LUSC、READ、STAD、PRAD、UCEC肿瘤组织中的表达相对较高（下图A）。2、配对比较分析结果显示，AHSA1在BLCA、BRCA、CHOL、COAD、ESCA、HNSC、LIHC、LUAD、LUSC、PRAD、READ、STAD肿瘤组织中过表达（下图B）。

二、AHSA1在泛癌中的预后价值1、Kaplan-Meier生存分析结果表明，AHSA1高表达在LIHC、LUAD、ESCA和KIRP患者中提示预后较差（下图A-D）。1、在LIHC、LUAD、ESCA和KIRP肿瘤患者中，异常高表达的AHSA1与较差的DSS密切相关（下图E-H）。

**三、AHSA1表达与肿瘤微环境
**1、使用TIMER数据库评估AHSA1表达与免疫细胞浸润之间的相关性。结果表明，AHSA1与多种肿瘤的CD4+Th1、CD4+Th2和MDSC细胞呈显著正相关，与LIHC中的B细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞和髓系树突状细胞呈显著正相关（下图A）。
2、分析AHSA1表达与免疫检查点抑制剂之间的相关性。结果表明，AHSA1与LIHC、THCA和THYM中的多个免疫检查点呈显著正相关，与ACC、BRCA、GBM、HNSC、LUSC、LGG和PRAD中的多个免疫检查点呈显著负相关，与LIHC、THCA和TGCT中的CD274、CD276和CTLA4呈显著正相关（下图B）。
3、分析AHSA1表达与EMT相关分子表达之间的联系。结果显示，AHSA1表达与LIHC、KIRC和UVM中的EMT相关分子之间呈显著正相关，与MMP2、CCL2、CFH和CYP1B1呈显著负相关（下图C）。

4、研究AHSA1表达与细胞焦亡相关分子之间的相关性。结果表明，AHSA1与BRCA、LGG、LIHC、PRAD和THCA中的焦亡相关分子呈显著正相关（下图A）。5、讨论AHSA1表达与自噬相关分子之间的相关性。结果显示，AHSA1与BRCA、COAD、LIHC、LUAD、PAAD、PRAD和TGCT中的自噬相关分子呈显著正相关（下图B）。

6、观察AHSA1表达与TMB和MSI之间的关联。结果表明，AHSA1在CESC、COAD、HNSC、KIRC、LUAD、STAD和UCS中与TMB密切相关（下图C-D）。

**四、分子相互作用网络和富集分析

**1、利用GeneMANIA和comPPI分析与AHSA1相互作用的分子。结果显示，AHSA1与AMD1、HSP90AA1、DNAJB4和HSP90AB1具有潜在相互作用，主要功能包括蛋白质折叠、DNA生物合成和活性氧代谢等（下图A）。
2、利用ssGSEA算法预测AHSA1表达与HCC中24种免疫细胞浸润水平的关系。结果表明，AHSA1在HCC中与T辅助细胞、Th2细胞、巨噬细胞和iDC呈正相关，与细胞毒性细胞和树突状细胞呈负相关（下图B）。
3、对从GeneMANIA获得的与AHSA1相互作用的分子进行GO和KEGG富集分析。结果表明，这些分子主要富集在细胞粘附、钙粘蛋白结合、泛素-蛋白连接酶结合、应激蛋白结合、热休克蛋白结合和Hsp90蛋白结合中（下图C）。

4、生物过程富集分析表明，这些分子主要参与RNA分解代谢、mRNA分解代谢过程、蛋白质靶向和蛋白质折叠等；KEGG分析表明，这些分子主要参与核糖体、RNA转运、剪接体和HIF-1α信号通路等（下图D）。此外，作者还构建了GO和KEGG之间的交互关系网络（下图E）。

**五、AHSA1在肝细胞癌中的临床相关性分析
**1、在肝细胞癌（HCC）中分析AHSA1表达与临床分期之间的关联。结果表明，AHSA1在较高的病理阶段（下图A）、T阶段（下图B）和组织学分级（下图C）中表达水平较高。同时，AHSA1表达还与AFP表达水平和血管侵袭状态有关（下图D-E）。
2、通过ROC分析AHSA1对HCC总生存率的预后评价效果。结果表明，AHSA1在HCC中表现出良好的预后评价性能（下图F）。
3、通过单因素和多因素COX回归分析结合临床数据进一步评估AHSA1在HCC中的预后作用。结果表明，AHSA1是HCC的独立预后因素（下图G）。

4、构建基于AHSA1表达和病理分期的列线图（下图H），通过校准曲线评估HCC患者1、3、5年后预后评估模型的准确性。结果显示，列线图具有非常好的准确性，几乎接近理想模型（下图I)。

5、分析AHSA1在ICGC-LIRI-JP队列癌旁组织和肿瘤组织中的差异表达。结果显示，AHSA1在HCC肿瘤组织中表达较高（下图A-B）。生存分析结果显示，在ICGC队列中，AHSA1高表达的HCC患者的生存预后较差（下图C）。单变量和多变量COX分析显示AHSA1是HCC的独立预后危险因素（下图D）。

6、RT-PCR结果显示，AHSA1在HCC细胞中的mRNA表达水平较高（下图E）；Western blotting实验结果显示，AHSA1蛋白在HCC细胞中的表达水平更高（下图F）；免疫组化结果显示，AHSA1蛋白表达水平在HCC组织中更高（下图G）。

六、AHSA1对HCC细胞增殖、迁移和侵袭的影响1、构建3个AHSA1的shRNA敲除载体并转染到HUH7细胞中，其中SH2-AHSA1的敲除效率最高（下图A-B），将载体命名为shAHSA1。CCK结果显示，AHSA1敲低48小时后，细胞增殖能力明显降低（下图C）。2、细胞划痕试验结果显示，敲除AHSA1后，HUH7细胞的愈合能力明显减弱（下图D-E）；Transwell实验结果显示，敲除AHSA1后，HUH7细胞的迁移能力（下图F-G）和侵袭能力（下图F-H）明显减弱。

3、通过RT-PCR和WB验证HCCLM3细胞中AHSA1的敲低效率（下图A-B）；CCK8结果显示AHSA1敲低后显著抑制HCCLM3细胞增殖（下图C）；划痕和transwell实验表明AHSA1敲低后显著降低了HCCLM3细胞的迁移/侵袭能力（下图D-E）。

总结
研究通过泛癌分析发现，AHSA1在许多肿瘤组织中表达上调，且与多种肿瘤预后、免疫细胞浸润、免疫检查点抑制剂、TMB和MSI密切相关。细胞实验证明，敲低AHSA1可以降低HCC细胞的增殖活性、细胞迁移和侵袭能力。本研究结果表明AHSA1有希望作为潜在的肿瘤预后生物标志物，并可能在HCC细胞的增殖和迁移中发挥重要作用。