【单细胞转录组】人类T细胞亚群分析Marker基因汇总
2020-04-01 本文已影响0人
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文献：Global characterization of T cells in non-small-cell
lung cancer by single-cell sequencing
T 细胞（全部）：CD3+
Naive T cell:
CD3, CD4, CCR7, CD62L+, IL-7R (CD127), THPOK
Tef（效应T细胞）：
-
辅助T细胞（Helper T）：CD3+CD4+CD8-T细胞
- Th1: CD3+CD4+CD30-, IL-12R, CXCR3, T-bet, STAT4, STAT1，IFNγ, IL-2,, IL-18、—
- Th2：CD3+CD4+CD30+， CCR4，IL-2, IL-4
- Th9: CD3, CD4, PU.1, IL-9, IL-10
- Th17: CD3, CD4, IL23-R, CCR6, IL-1R, CD161, STAT3
- Th22: CD3, CD4, CCR10
- Tfh: CD3, CD4, CCR5, SLAM, OX40L, CD40L(CD154), ICOS, IL-21R, PD1, STAT3, IL-21
-
Treg（调节T细胞）:CD4+CD25+Foxp3+ ，CD127+, CD152+，TGFβ, IL-10, IL-12， STAT5+ (ps:只通过CD4+CD25+双阳性来定义的Treg细胞并不完全准确)
- TR1（IL-10）：CD3， CD4
- Natural Treg: CD3，CD4, CD25, CTLA4, GITR, FOXP3, STAT5, FOXO1, FOXO3, IL-35, IL-10
- Inducible Treg: CD3，CD4, CD25, CTLA4, GITR, FOXP3, STAT5, FOXO1, FOXO3, SMAD2, SMAD3, SMAD4, IL-10
-
细胞毒性T细胞 Cytotoxic T（杀伤性T细胞）：CD3+CD4-CD8+T细胞
- Tc1（IFN-γ）：CD3+CD8+CD30-
- Tc2（IL-4、IL-5、IL-10）：CD3+CD8+CD30-
-
Tex（耗竭T细胞Exhausted T）：CD3+，CD8+，PD1, TIM3, 1B11, LAG3, BLIMP1
-
无能/失能T（Anergic T）:CD3, BTLA, GRAIL, CBL-B, ITCH, NEDD4
-
记忆T（Memory T）：
- 中央记忆T: CD3, CCR7+, CD44, CD62L+, CD3, IL-7R(CD127), IL-15R, MBD2
- 效应记忆T: CD3, CCR7-, CD62L-, CD44, IL-7R(CD127), IL-15R, BLIMP1
-
NKT: SLAMF1, SLAMF6, TGFBR, VA24, JA18
-
γδ T：CD3，IFNγ, IL-17A, IL-17F, IL-22
-
CD8αα T ：CD3,CD8αα, B220，IL-10, TGFβ
- 另外根据S100A4、CCR7、IL32和ISG15，明确分离3个CD4 T细胞群体(幼稚型、记忆型、ifn激活型)
肿瘤中的浸润CD8 T细胞
细胞毒性T细胞 Cytotoxic T（杀伤性T细胞）、Tex（耗竭T细胞Exhausted T）
