项目文章 | IF=10.183,单细胞与全转录组关联分析探究妊

2022-12-05  本文已影响0人  ee00dc6faab7

子痫前期(PE)是妊娠的主要并发症,被认为是一种缺血性胎盘疾病,由螺旋动脉重塑受损和滋养层细胞浸润不足引起。有证据表明miRNA的失调与滋养细胞功能障碍和PE发展相关。然而,胎盘miRNA在PE发病机制中的作用仍不清楚。2022年9月,重庆医科大学第一附属医院童超研究员与漆洪波教授团队在期刊Molecular Therapy: Nucleic Acids 上发表了题为:“MiR21 modulates the Hippo signaling pathway via interference with PP2A Bb to inhibit trophoblast invasion and cause preeclampsi”的研究论文,该研究通过结合单细胞和全转关联分析揭示了miR21在娠期PE发病机制中的潜在调控作用。该研究中全转录组的测序和分析由诺禾致源提供。

接下来小诺带大家一起学习下这篇高分文章:

文章概况

MiR21 modulates the Hippo signaling pathway via interference with PP2A Bb to inhibit trophoblast invasion and cause preeclampsia

发表期刊:Molecular Therapy: Nucleic Acids

发表时间:2022. 09. 15

测序技术:10x genomics 3’转录组、全转录组

研究方向:子痫前期发病机制研究

样本情况:3个健康人蜕膜和胎盘,44790个细胞

研究亮点

在本研究中,作者鉴定得到miR21,先通过全转录组测序初步探究miR21的下游靶点,进一步通过单细胞测序发miR21可以通过干扰PP2A Bb调节Hippo信号通路,进而抑制绒毛外滋养层(EVT)侵袭,引起子痫前期(PE)。为miR21-PP2A Bb-Hippo信号轴在转录后水平调控PE发病机制提供了新的见解。

研究路线

主要研究结果

1. 通过全转录组测序探究miR21对滋养层细胞功能影响机制

首先通过微阵列鉴定了正常和PE胎盘之间差异表达的miRNA,发现在PE样本中miR21表达最显著上调,并通过ddPCR及FISH进行了验证,说明PE滋养层细胞中miR21表达上调。进一步构建高表达miR21的滋养层细胞系,对其进行模拟和抑制转染,发现miR21高表达会抑制滋养层细胞侵袭和迁移。为了阐明miR21对滋养层功能影响的潜在调节机制,我们对miR21丰度上调和下调的细胞系进行了全转录组测序,GO富集分析发现miR21模拟处理的细胞系上调PI3K-Ak、Hippo信号通路。进一步将重点放在了Hippo信号通路中关键蛋白YAP上,通过Western印迹分析表明,在miR21过度表达细胞系中,细胞质YAP增加,而核YAP急剧减少。在人PE胎盘中也是如此,说明miR21表达与滋养层中YAP的核定位之间存在负相关。以上证明,PE中异常miR21升高导致滋养层细胞中Hippo通路的激活,导致细胞质中YAP的隔离,并随后抑制下游基因。

2. miR21通过 LATS1或YAP磷酸化及抑制PP2A-Bb来调节滋养层的侵袭和迁移

通过对三名健康受试者的胎盘和蜕膜进行10x单细胞转录组测序,获得了44790个细胞,并鉴定了15种细胞类型。绒毛外滋养细胞(EVT)中YAP1和LATS1的表达水平丰富,表明Hippo通路可能在EVT中起关键作用。为进一步确定LATS1-YAP信号轴的磷酸化是否介导miR21对滋养层侵袭和迁移的影响,构建FLAG-LATS1T1079A/S909A 和 Myc-YAP-5SA 突变细胞系,发现miR21水平的调节对细胞侵袭和迁移没有影响,表明miR21诱导的LATS1和YAP磷酸化对于抑制滋养层侵袭和迁移至关重要。为了研究miR21和PPP2R2B相互作用,测定PPP2R2 B表达水平,并发现两者存在负相关,说明miR21通过抑制PP2A-Bb来调节滋养层的侵袭和迁移。

3. 妊娠早期胎盘miR21丰度的增加诱导小鼠出现PE样表型

为了验证miR21对PP2A-Bb/Hippo和体内细胞侵袭的调节作用,进行小鼠体内试验验证。在妊娠早期施用agomir-miR21纳米粒子可以有效上调胎盘miR21的水平,发现miR21上调会导致导致胎盘异常发育且生长受限,PP2A-Bb水平显著降低、YAP滞留在细胞质中,与我们在体外模型和人类胎盘中的发现一致。

结论

在这项研究中,发现PE的胎盘中miR21表达的异常上调,导致PP2A-Bb的抑制,从而降低LATS1的去磷酸化,这些影响最终导致YAP在细胞质中的过度磷酸化和隔离,全面描绘了PE发病机制。

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参考文献

[1] Hu M Y, Zheng Y X, Liao J J, et al. miR21 modulates the Hippo signaling pathway via interference with PP2A Bβ to inhibit trophoblast invasion and cause preeclampsia[J]. Molecular Therapy-Nucleic Acids, 2022, 30: 143-161.

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