Histcite快速了解一个领域

帕累托二八定律

百分之八十的价值来自于百分之二十的因子，其余的百分之二十的价值则来自于百分之八十的因子

所以，书读经典，要事第一，任何事情先找方法就是提高效率，可以更快捷地进行工作的关键

话不多说，本篇文章主要介绍一下最近才学会的一个高效检索文献的工具----Histcite，可以用于迅速锁定一个领域内的高质量文献和开山鼻祖，大大减少文献筛选的功夫。

背景介绍

我通常检索文献的方法是在pubmed或者WOS中直接输入关键词，按照被引频次由高到低进行排列，然后浏览每一篇文献的摘要，逐步找出合适的文献。但是这样一方面往往信息量非常大，有的关键词会检索出上万篇论文，高被引文献也很多，往往没有时间和精力一篇一篇阅读下去；另一方面，有的文献虽然引用频次高，但是其实跟你想研究的领域没有太大的关系，主要是被其他领域所引用。这时候，就会低效率地浪费不少时间。无意间发现Hisccite（History of Cite）软件，可以分析WOS核心数据集中的文献，迅速找出自己研究领域内使用频次最高的质量最好的文献，觉得非常有用。Histcite 是由SCI的发明人加菲尔德开发，可用图示的方式展示某一领域不同文献之间的关系，根据在所参与分析的文献中引用于被引用的频次，判断文章在专业领域内的地位。然后自己选择出自己需要的高分文献，导出并导入Endnote中进行管理。

分析流程

比如我检索的关键词是GWAS。

1. 首先打开WOS数据库，检索栏选择Web of science核心合集。输入检索关键词：GWAS，进行research。
   ![WK8KHN45FO@)]V8Y8WJDN9C.png](http://upload-images.jianshu.io/upload_images/1782692-067b2bf468a5f9f9.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240)
   可勾选左侧进行检索结果精炼。我选择research area里面的GENETIC HEREDITY进行Refine。共检索出2535条结果。
   %SOLAKK5PDC}@K0A99I9W7G.png

2. 导出这2535条结果：选择Save to Other File Formats.

   
   0EJ82`6VCP%R)4F@(D9OW99.png
   

   Number of records：填写1-500 (随后依次填写501-1000,1001-1500,1501-2000,2001-2500,2501-2535导出全部记录。不能多填，因为一次只能导出500条记录）
   Records Content：Full Record and Cited References
   Fill Format：Plain Text
   然后点击send

   
   R))HZXKIF18_ODAH4E%VYIA.png 将文件(savedrecs)保存至相应的文件夹下即可。
3. 在C盘中建立文件夹：fakepath。将刚才保存的导出文献数据复制到此文件夹里。因为这好像是Histcite的默认读取路径，其他的路径貌似不能够导入分析，在我的电脑上是这样。
4. 启动Histcite软件，弹出IE浏览器页面
   OUOXZJGQW6P~0)WQXBLQOIY.png
   点击左上角的File-----浏览------在C:\fakepath\下导入文件(如果有多个文件，依次导入即可)----Add File
   ![Y(DINLE8`72IIRIR_JP}C]N.png](http://upload-images.jianshu.io/upload_images/1782692-0fd08bb32285d835.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240)
   最终导入完2535条结果，显示界面如下：
   ![}5N4$TF5RK37EJ]BI%39RBI.png](http://upload-images.jianshu.io/upload_images/1782692-a164e9f5f56c870d.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240)
   对参数的理解详见参数介绍。

5. 点击工具栏上的Tools, 选择Graph Maker，弹出作图界面

   
   YCM8B$8{HWK(`N}A73(CTV0.png](http://upload-images.jianshu.io/upload_images/1782692-2ec4bb2195cce8e4.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240) 检查基本参数符合要求后，点击Make Graph. ![6JU3601AV`VYTB(()WS0YBS.png
   

   此即为文献引用图。可分析见到，所见所领域内的文献从2007年开始，2007年的应该是此领域内的比较是早的文献，2010年的是文献高发的年份。2010年，2011年都有引用频次很高的文献，这些文献可能是所研究领域内的重要文献。作图界面并不复杂，关键选择是参与做图的文献数量，其余参数都是调整图片中方块、线条和字体的大小。这里选择的是 LCS 排名前 30 的文献。如果对图中某篇文献感兴趣，可以直接点击它，软件会在一个新窗口中打开该文献的详细信息，我们可以预览一下论文的标题和摘要
   基本软件操作流程就是这样，下面详细解读一下各个参数的意义及进阶功能。

参数介绍

初始界面

![}5N4$TF5RK37EJ]BI%39RBI.png](http://upload-images.jianshu.io/upload_images/1782692-a164e9f5f56c870d.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240)
有四个重要参数需要我们理解：**LCS，GCS，LCR，GCR **

• LCS：是local citation score的简写，即本地引用次数。它表示这篇文章在当前数据集中被引用的次数。
• GCS：是global citation score，即引用次数，它表示这篇文章被整个WOS数据库中所有文献引用的次数，也就是你咋web of science网站上看到的引用次数。
• LCR：是local cited references ，本地参考文献数，它表示这篇文献的参考文献在当前数据集中的数量，即这篇文献引用别人的情况。如果一篇文章的 LCR 值高，意味着它引用了大量的你限定领域内文献，极有可能是综述文章。
• CR：是cited references，即文章引用的参考文献数量。如果某篇文献引用了50篇参考文献，则CR为50。这个数据通常能帮我们初步判断一下某篇文献是一般论文还是综述。
  一篇文章GCS很高，说明被全球科学家关注较多。但是如果一篇GCS很高，而LCS很小，说明这种关注主要来自与你不是同一领域的科学家。此时，这篇文献对你的参考意义可能不大。
  LCR与CR对应是local cited references，是指某篇文献引用的所有文献中，有多少篇文献在当前数据库中。
  LCS可以快速定位一个领域的经典文献， LCR可以快速找出最新的文献中哪些是和自己研究方向最相关的文章。
  进行作图的时候，通常就是选择LCS进行

补充遗漏的重要文献

![X2W{(U79Z[QZMLQ]SI9I7E.png
点击上方Cited references,此处表示的是所有你导入文献的引用文献

6T_CIWYWGF5XPM%CR(GXTSJ.png

前面带有绿色的+号，说明这篇文献不在你当前导入的文献中。Recs是一个非常重要的参数，它表示这篇文献在当前数据集中被引频次，通过 Recs 排序，我们很快就可以定位重要的被遗漏的文献。所以我们很有必要把重要的遗漏文献添加进入进行分析。添加的方法如下：

• 复制遗漏文献的DOI，在WOS中检索出相应的文章题目
• 点击绿色的+号，把文章题目复制进入Title位置，点击apply changes，然后close对话框即可。
  ![LP1$U]86{}5NXOA74BSU6S2.png](http://upload-images.jianshu.io/upload_images/1782692-850d1f688c5ec9f5.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240)
  看看是不是已经有了变化？绿色箭头不见了，上方出现红色的update lists，表明这篇文献已经被添加进入目前分析的文献中。依次类推，为了更全面找到基因遗传性领域内GWAS的重要文献，我把排列位置在前20位的遗漏文献文献都手动添加进去。
  P$WVVSBLVTK@P002LDOK43N.png
  添加好文献之后，再次进行作图分析，这时候，可以看到图已经发生了变化

EPQ6S~1_IVPS9N5DI7MX8O4.png

重要文献导入endnote进行管理

• 对于你感兴趣的文献（我感兴趣的是按照LCS从高到低进行排列），点击Tools----Make & Tag，select records with (我选择是1-50)，select records only， 点击Mark即勾选完成

  
  7%$T90QGFI2EJ$L5U%SSAA3.png
  

  点击上方的Makers，即精炼出我所勾选的50篇重要文献

• 点击File----Export----Records----save到相应的文件夹，后缀改为.txt

• 新建一个endnote文件，将导出的.txt文件导入，即形成endnote文献集，通过find full text功能批量下载全文，进一步阅读浏览。

  
  ~I){((3B(PCULTXSETX%KZU.png

注意事项

1. Histcite软件下载 (http://science.thomsonreuters.com/scientific/m/HistCiteInstaller.msi
2. 如果刚开始向HistCite内导入文献出问题的话，需要把savedrecs文件中开头的Web of Science改为Web of Knowledge，我的就是这样解决的。

用了几次HistCite，感觉对快速了解一个领域还是非常有用的。当然功能还在继续摸索中，希望可以不断找到提高做事情效率的方法，能够更高效地做好事情。