生信星球培训第四十一期

学习小组Day4 波波嘟

2020-03-05  本文已影响0人  林玮民

讲到R语言了!

由于之前用过R语言来进行一些分析,所以对R语言的基本操作还是有一点点基础的
但是最近在做一些单细胞测序分析的时候发现仅仅用R语言还是不够的,很多单细胞的分析包都是用python写的,然后python应该是在linux系统上运行的比较好,我在windows的电脑上一些指令就不是很顺畅,以后如果要涉及到上游测序数据分析的话还要学更多种代码语言,不单单是只会加载一个包调参数就可以解决的
放上做箱线图时候的一些代码吧,最基础的

install.packages("ggpubr")
install.packages("magrittr")
install.packages("ggplot2")
library(ggplot2)
library(magrittr)
library(ggpubr)
data<-read.table("~/Desktop/CBD/IFIT3.txt",sep = "\t",header = T)
p <- ggboxplot(data, x="Group", y="mRNA_level", color="Group", palette = "npj", add = "jitter", title = "IFIT3")
p

嗯不管啦,交作业啦!

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