10X单细胞WGCNA分析联合10X空间转录组WGCNA分析

各位同学，大家好，今天我们继续WGCNA的分析点，这一次，我们需要联合两种技术，10X单细胞和10X空间转录组，也就是在多组学层面上分析WGCNA得到的模块，关于WGCNA，之前也分享过，文章在10X单细胞（10X空间转录组）做WGCNA分析的智慧，但智慧有了，还要升华，才能为我所用，祝我成功。

10X单细胞做WGCNA不必多言，大家应该都了解的很深了，WGCNA技术很早就有，如果你已经做了10X单细胞分析有一年以上，还不明白10X单细胞做WGCNA的意义，拉出去枪毙五分钟。

图片.png xia_A1.ModuleSampleRelation.png

这里的cluster 大家一定要注释，不进行注释的分析结果都是耍流氓。这些图值得关注的点，上篇文章已经分享过了，这里不在赘述。

模块的下游分析策略

图片.png

那么根据这个策略，大家就应该会分析得到下面的结果

首先是cluster之间的网络关系（这个图不会的，做了单细胞分析有一年以上的，面壁去）

18814178-05e03caa3ad9199a.png

然后是模块功能网络

18814178-042045a1b3ed13ff.png

接下来看10X空间转录组的WGCNA（空间模块和形态学）

图片.png

各个模块和空间层级的关系，很重要

上次文章提到的思路，大家好好看看，10X单细胞分析得到的模块也可以运用于空间，这个时候，不知道大家有没有深刻的理解。（没有的话， 好好学习吧）

图片.png

10X单细胞和10X空间转录组模块的关联

图片.png 图片.png

这个关联，显示的是从两个角度来看待共表达模块的问题，意义重大， 尤其发育。

生活很好， 你不加油，不进则退了