quickGO:在线查询GO和GO注释信息的网站
2018-10-01 本文已影响40人
生信修炼手册
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quickGO是EMBL-EBI发布的网站,通过该网站,可以快速的查询Go Terms和Go注释相关信息,官网如下
https://www.ebi.ac.uk/QuickGO/
通过首页的搜索框,可以快速进行检索。
在搜索框中可以输入3种类型的信息
-
GO number
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GO name
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gene product
检索时支持自动联想,可以根据输入数据自动匹配相关的GO和基因产物信息, 示意如下
对于Go Terms 而言,在检索结果中包含以下几种信息
1. Overview
展示每个GO Terms的编号,名字,详细的描述信息,所属分类等基本信息。
2. Ancestor Chart
展示该Go Term到根节点的结构,示意如下
3. cross-references
展示该Go Terms与其他数据库的连接
除了以上信息外,还有更多其他种类的信息,可以到官网上详细查看。
对于GO annotations的信息,展示方式如下
通过上方的下拉按钮,可以对数据进行筛选,添加了筛选条件的按钮会变成绿色。
筛选完成后,可以点击Customise
筛选需要展示的列信息,然后点击Export
导出结果。
通过这种方式,可以方便的导出某个物种的GO注释信息。
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