生信星球培训第七十二期

学习小组Day3-CYJ

2020-07-22  本文已影响0人  ButAlways_40e6

先接着昨日的学习

练习cd操作:进入tmp目录,然后查看当前路径,然后返回主目录

cd2.png

练习删除操作:

删除doodle.txt
删除整个huahua目录
删除rm_test(已经是空目录了)


cd3.png

vi

新建脚本或文本文档
进入编辑模式之后,先输入 i ,进入输入模式
编辑完成后,按 Esc键,退出编辑模式
在左下角输入:x,保存并推出


vi2.png

cat

cat 文本文件 查看并将文本文件的内容输入到屏幕
q 退出cat
head 默认输出前十行
tail 默认输出后十行
- n 行数 自定义输出几行

cat.png

cp

复制文件
cp file1 file2 复制file1,命名为file2

cp.png

mv

将文件移入文件夹,或者重命名
mv file1 路径a 将file1移入到路径a
mv file1 file2 将file1重命名为file2

mv.png

解决下面问题 https://man.linuxde.net

ls输出的是横向的列表,怎样输出长格式列表(提示:搜索ls)

-l:以长格式显示目录下的内容列表。输出的信息从左到右依次包括文件名,文件类型、权限模式、硬连接数、所有者、组、文件大小和文件的最后修改时间等;


ls -l.png

如何查看长格式列表中文件的大小?(提示:ls)

ls -lh

查看Linux系统版本

内存与硬盘空间?(提示:分别是三个命令)
lsb_release -a 查看系统版本
df -lm 查看硬盘空间情况
free -m 查看内存

lsb.png

怎样建立类似/tmp/tmp1/tmp1.1 这样的层级目录(提示:搜索mkdir)

mkdir -p tmp/tmp1/tmp1.1

mkdir -p.png

怎样删除这些层级目录(提示:搜索rm)

rm -r 递归处理,将指定目录下的所有文件与子目录一并处理

rm -r.png
Linux系统常用命令.png

Day3 Linux环境下的软件安装

Miniconda

conda(Linux的应用商店)的精华版

下载miniconda

1.搜索“miniconda 清华" (清华的conda镜像网站)

  1. 查看服务器是多少位的
    uname -a 64位
    uname -a.png
  2. 安装最新版本
  3. 复制下载链接
  4. 进入biosoft目录
    wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
    wget.png

安装miniconda

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

激活miniconda

source ~/.bashrc

激活.png

添加镜像

# 使用清华镜像 conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda conda config --set show_channel_urls yes

使用conda

查看当前服务器上安装的所有软件列表

conda list

conda list.png

搜索conda软件

conda search soft

安装软件

conda install soft -y

卸载软件

conda remove soft -y

进阶

查看conda环境

conda info --envs

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