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2019-01-04 本文已影响6人
上海鹿明生物
冠状动脉疾病综合代谢组学特征分析
基本信息
材料:冠心病患者血清
主要技术:LC-MS全代谢组、靶向代谢组
期刊: J. Am. Coll. Cardiol.
影响因子:19.896
文章摘要
对来自四个中心的2324名疑似冠状动脉疾病(CAD)患者进行造影检查,分组如下:正常冠状动脉(NCA),非梗阻冠状动脉粥样硬化(NOCA),稳定型心绞痛(SA),不稳定型心绞痛(UA)和急性心肌梗塞(AMI)。
通过LC-Q-TOF-MS分析代谢图谱并进行分析。通过对CAD样本的交叉验证比较,共鉴定了89种差异代谢产物。改变的代谢途径包括降低的磷脂分解代谢,增加氨基酸代谢,增加短链酰基肉碱,减少三羧酸循环,以及减少初级胆汁酸的生物合成。作者还发现12个生物标志物AUC值可达0.938至0.996(n = 1,086),在测试阶段预测值为89.2%至96.0%(n = 933),外部集也达到85.3%到96.4%(n = 305)。
方法流程
CAD患者 OPLS-DA统计分析 代谢通路富集 代谢产物及相关性分析 诊断标志物 ROC曲线及外部测试小鹿推荐
代谢组是寻找生物标志物最常用的手段之一,但目前大多数代谢产物生物标志物还不足以取代现有的临床测试,一方面,疾病阶段的复杂性使大多数代谢产物的预测结果受到影响,另一方面,重复性不佳而导致生物标志物的灵敏性和特异性减弱。本文通过对冠心动脉疾病的不同分组及交叉验证确定了代谢标志物,并利用来源不同的样本进行验证,保证了代谢产物标志物的灵敏性、特异性及可重复性,值得临床研究的借鉴。
文献来源
Fan Y et al. Comprehensive Metabolomic Characterization of Coronary Artery Diseases. 2016, J. Am. Coll. Cardiol.