下载SRA数据（四）

转自公众号：茶与生信

软件名：SRA Explorer

           http://sra-explorer.info/

开发者：瑞典斯德哥尔摩的Phil Ewels

          个人主页：http://phil.ewels.co.uk/

           MultiQC也是其参与开发的项目

软件网页界面：

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搜索方式：支持输入：GSE、SRA、SRP、PRJ、EPR，甚至直接通过物种+组织+测序技术搜索。即使SRX包括超过一个数据集（多个SRR），也没问题。

实例：

（1）输入ID

例如PRJNA429080，点击搜索/enter键，显示其下的所有数据集

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（2）选择要下载的数据集

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（3）选择下载方式

点击右上角的购物车标志

然后选择下载方式。例如fastq、sra，或者样本信息。

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（4）下载

直接下载还是拷贝下载链接，任你选择

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如果你选择Aspera下载，它还能给出下载脚本，并且帮你把每个数据文件进行了重命名，非常人性化。

补充：

可以关键词组合搜索，但每个词中间不能出现空格，不能把RNAseq 写成RNA seq，不能把chipseq写成chip seq

如果下载数据量比较大的话，建议检查一下下载脚本，以防遗漏。