生信星球培训第四十七期生信星球47期学习

学习小组Day7笔记-------猫爪草

2020-03-28  本文已影响0人  TeeM0猫爪草

测序基础
测序--核酸DNA分子一级结构的测定。迄今为止发展了三代。
  
参考内容:https://mp.weixin.qq.com/s/H1xKEVmAdTCP4EUNaeGwNw

第一代 DNA测序技术 桑格尔-双脱氧链终止法。

第二代 DNA测序技术(next generation sequencing,NGS )-循环阵列合成测序法。
主要平台有:
  1.罗氏454公司的GS FLX sequencer
  2.Illumina solexa genome analyzer
  3.ABI公司的SOLiD sequencer
 
二代测序大幅度提高了测序速度,降低了测序成本,保持了高准确性。缺点是读长短,拼接困难,pcr技术增加了测序的错误率。

第三代 测序技术以PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore Technologies 的纳米孔单分子测序技术为标志,不需要经过PCR扩增,超长读长,可达二代测序的100倍以上,实现了对每一条DNA分子的单独测序。错误率比二代要高,达到10-15%。

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