Day3-Care学习总结
2020-03-22 本文已影响0人
Care_956f
今天学习了Linux环境下软件的安装,先上思维导图:
![](https://img.haomeiwen.com/i22485151/f944f9ac76cd44ac.png)
在Windows系统中,软件安装是在其应用商店搜索软件,再下载安装。那么在Linux小企鹅中,conda就扮演Windows中应用商店这一角色,接下来总结一下linux中的软件下载安装:
1. miniconda3的下载安装和激活
下载:wget 下载链接
![](https://img.haomeiwen.com/i22485151/2041145f8b4731e3.png)
安装:bash 脚本名
激活:source ~/.bashrc
![](https://img.haomeiwen.com/i22485151/8051d0a59bf49c33.png)
2. 查看conda内的软件列表:conda list
![](https://img.haomeiwen.com/i22485151/1ddcac7ab9c3bd95.png)
3. conda内搜索软件:conda search 软件名
![](https://img.haomeiwen.com/i22485151/cb708d8a9ce1a103.png)
4. 下载软件:conda install 软件名(自动安装加 -y)
![](https://img.haomeiwen.com/i22485151/b59916716272a59e.jpg)
5. 卸载软件:conda remove 软件名(自动删除加 -y)
![](https://img.haomeiwen.com/i22485151/b78de7afc98ef328.png)
6. 创建conda环境:如conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
![](https://img.haomeiwen.com/i22485151/aff4ca5d29a4e4f9.png)
创建失败,暂时不知道原因。