组装简介

基因组 应该是 生信分析的基因组。一个好的基因组会让生信分析事半功倍。
基因组组装简单的理解：借助工具进行 reads连接。
工具一般是指软件。

1：组装的软件

针对数据的不同，一般的组装软件 也有所不同。
pacbio的组装软件是 falcon；
ONT的组装软件是 wtdbg；
还有一些其他的较好的软件 ：canu、nextdenovo；

reads 连接完之后，需要进一步的矫正，所以 需要借助到矫正的软件。

2：矫正的软件

三代的矫正软件：racon;
二代的矫正软件：nextpolish 、polish；

经过测试 ，推荐大家使用 nextpolish，矫正次数 2-3次 足以。

基因组组装结束，需要评判组装的好与坏，目前一般基因组的评估软件：busco。